PA-Star-Web:获得最佳生物序列多比对的web服务器

Enéias Paulo de Oliveira, D. Sundfeld
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摘要

序列比较是生物信息学中最重要的操作之一。比较多个序列,问题就变得复杂,需要一个高数量的内存和计算时间。PA-Star是一种实现多个序列的最佳多重对齐的工具。然而,这个工具的结果只有通过命令行。在这项工作中,我们提出了一个web服务器,使访问结果与web浏览器。web服务器计划部署在一个云计算提供商的多个虚拟机上,并可以扩展以适应工作需求。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
PA-Star-Web: web server para obtenção do alinhamento múltiplo ótimo de sequências biológicas
A comparação de sequências é uma das operações mais importantes da Bioinformática. Ao se comparar múltiplas sequências, o problema torna-se complexo e exige uma alta quantidade de memória e tempo computacional. O PA-Star é uma ferramenta que obtém o alinhamento múltiplo ótimo de múltiplas sequências. No entanto, essa ferramenta produz resultados exclusivamente através da linha de comando. Neste trabalho, propomos um web server para disponibilizar o acesso aos resultados com um navegador web. O web server foi planejado para ser implementado em múltiplas máquinas virtuais em um provedor de computação em nuvem e que podem ser aumentadas para se ajustar a demanda de trabalho.
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