植物DNA样本中的次生代谢产物和其他污染分子

Gabriel Vianna, Marceli Raquel Burin, Vanessa Backes Nascimento Diel
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Material e métodos: Trata-se de uma revisão bibliográfica realizada na plataforma do Google Acadêmico entre os anos de 2017 a 2021, utilizando as palavras-chave: “Contaminantes DNA vegetal”, “Substâncias secundárias” e \"Purificação de amostras contaminadas\" Resultados: Os polissacarídeos podem inibir o processo de PCR, inviabilizando análises moleculares já os compostos fenólicos e outras substâncias secundárias podem oxidar e ligar-se ao material genético diminuindo sua integridade. Alguns estudos indicam que os compostos secundários são mais abundantes em folhas adultas, por estas estarem a mais tempo expostas ao meio e ao herbivorismo. Porém, a também foi encontrado que plantas jovens possuem maior quantidade de metabólitos secundários do que plantas maduras. atores externos como a sazonalidade e fragmentação do habitat influenciam sobre os produtos alternativos gerados por elas, isso devido as consequências que o efeito de borda e os impactos ecológicos causados acarretam às plantas. Dentre as substâncias mais empregadas em protocolo de extração com a finalidade de purificar a amostra estão: as enzimas proteinase K que eliminam resíduos de proteínas, a RNAse que age sobre o RNA, o composto β-mercaptoetanol e o polímero PVP (polivinilpirrolidona), aplicados juntamente com os tampões para a eliminação de fenóis e polissacarídeos, e o clorofórmio e o álcool isoamílico usados para a eliminação de proteínas. Conclusão: É importante observar as condições do ambiente do qual se obtém a amostra vegetal, os aspectos físicos da planta e realizar o protocolo de extração com o intuito de eliminar ao máximos substâncias que possam interferir na obtenção de amostras de DNA de boa qualidade, dessa forma estudos moleculares podem ser realizados com eficiência.","PeriodicalId":138762,"journal":{"name":"Anais do I Congresso Brasileiro de Biotecnologia Vegetal On-line","volume":"47 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2021-11-22","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":"{\"title\":\"METABÓLITOS SECUNDÁRIOS E OUTRAS MOLÉCULAS CONTAMINANTES EM AMOSTRA DE DNA VEGETAL\",\"authors\":\"Gabriel Vianna, Marceli Raquel Burin, Vanessa Backes Nascimento Diel\",\"doi\":\"10.51189/rema/2407\",\"DOIUrl\":null,\"url\":null,\"abstract\":\"Introdução: Produtos do metabolismo secundário, proteínas ou polissacarídeos interagem com a molécula de DNA, contaminando-a, e comprometendo o resultado das técnicas moleculares como a PCR e a identificação de marcadores moleculares. 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摘要

简介:次生代谢产物、蛋白质或多糖与DNA分子相互作用,污染DNA分子,影响PCR和分子标记鉴定等分子技术的结果。因此,植物DNA提取方案经常被修改,以适应植物的要求,并获得高质量的样品。摘要目的:探讨次生代谢产物对DNA提取过程的影响,验证污染样品纯化的有效方法。材料和方法:这是一个文献回顾在谷歌学术平台的2017年至2021年之间,使用关键字:“污染物的植物DNA二级”、“物质”和“样品被污染净化过程结果:多糖可以抑制PCR,使分子已经二酚类化合物和其他物质的氧化和连接到遗传物质降低其完整性。一些研究表明,由于成年叶暴露在环境和草食条件下的时间较长,次生化合物在成年叶中含量较高。然而,我们也发现幼年植物比成熟植物具有更多的次生代谢产物。季节性和栖息地破碎化等外部因素影响它们产生的替代产品,这是由于边缘效应和对植物造成的生态影响的后果。物质,在协议中样品的提取和净化的目的是:酶蛋白酶K清除残留的蛋白质,核糖核酸酶作用于RNA,化合物β-mercaptoetanol和PVP聚合物(聚乙烯吡咯烷酮。),应用和卫生棉酚类和多糖的处置,氯仿和酒精isoamílico用于抑制蛋白质。结论:重要的是要注意环境条件得到的样品的物理特征、植物进行提取协议,以摄取到最大可能干扰获取高质量的DNA样本,这样可以有效地进行分子研究。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
METABÓLITOS SECUNDÁRIOS E OUTRAS MOLÉCULAS CONTAMINANTES EM AMOSTRA DE DNA VEGETAL
Introdução: Produtos do metabolismo secundário, proteínas ou polissacarídeos interagem com a molécula de DNA, contaminando-a, e comprometendo o resultado das técnicas moleculares como a PCR e a identificação de marcadores moleculares. Por este motivo, protocolos de extração de DNA vegetal são frequentemente modificados, visando a adaptação às exigências da planta e a obtenção de uma amostra de boa qualidade. Objetivos: Identificar a influência de metabólitos secundários no processo de extração do DNA e verificar formas eficazes de purificação da amostra contaminada. Material e métodos: Trata-se de uma revisão bibliográfica realizada na plataforma do Google Acadêmico entre os anos de 2017 a 2021, utilizando as palavras-chave: “Contaminantes DNA vegetal”, “Substâncias secundárias” e "Purificação de amostras contaminadas" Resultados: Os polissacarídeos podem inibir o processo de PCR, inviabilizando análises moleculares já os compostos fenólicos e outras substâncias secundárias podem oxidar e ligar-se ao material genético diminuindo sua integridade. Alguns estudos indicam que os compostos secundários são mais abundantes em folhas adultas, por estas estarem a mais tempo expostas ao meio e ao herbivorismo. Porém, a também foi encontrado que plantas jovens possuem maior quantidade de metabólitos secundários do que plantas maduras. atores externos como a sazonalidade e fragmentação do habitat influenciam sobre os produtos alternativos gerados por elas, isso devido as consequências que o efeito de borda e os impactos ecológicos causados acarretam às plantas. Dentre as substâncias mais empregadas em protocolo de extração com a finalidade de purificar a amostra estão: as enzimas proteinase K que eliminam resíduos de proteínas, a RNAse que age sobre o RNA, o composto β-mercaptoetanol e o polímero PVP (polivinilpirrolidona), aplicados juntamente com os tampões para a eliminação de fenóis e polissacarídeos, e o clorofórmio e o álcool isoamílico usados para a eliminação de proteínas. Conclusão: É importante observar as condições do ambiente do qual se obtém a amostra vegetal, os aspectos físicos da planta e realizar o protocolo de extração com o intuito de eliminar ao máximos substâncias que possam interferir na obtenção de amostras de DNA de boa qualidade, dessa forma estudos moleculares podem ser realizados com eficiência.
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