俄罗斯南部地区风沙牛亚群的微卫星基因座遗传结构

Н.В. Ковалюк, Л.И. Якушева, Ю.Ю. Шахназарова, А.Е. Волченко
{"title":"俄罗斯南部地区风沙牛亚群的微卫星基因座遗传结构","authors":"Н.В. Ковалюк, Л.И. Якушева, Ю.Ю. Шахназарова, А.Е. Волченко","doi":"10.33943/mms.2023.13.47.001","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Изучена генетическая структура субпопуляции айрширской породы крупного рогатого скота (n=600) в ряде хозяйств Краснодарского и Ставропольского краев по микросателлитным локусам: BM1818, BM1824, BM2113, ETH10, ETH225, ETH3, INRA023, SPS115, TGLA126, TGLA122, TGLA227, TGLA53. Определены количество гомозиготных и гетерозиготных животных по обозначенным выше локусам, наблюдаемая и ожидаемая гетерозиготность, индекс фиксации (Fis), породоспецифичные и часто встречающиеся аллели. В исследуемой выборке айрширского скота в среднем наблюдался минимальный излишек гетерозигот (Fis=-0,03). Установлено, что уникальными для представленной выборки айрширской породы являются аллели: 184 (локус BM1824) — с частотой встречаемости 5,0%, 77 (TGLA227) — с частотой встречаемости 2,0%, 180 (TGLA53) — с частотой встречаемости 0,3%, 222 (INRA023) — с частотой встречаемости 0,5%. У животных айрширской породы выявлен аллельный вариант, который не обнаружен у джерсеев, но достаточно часто в 15,7% случаев определялся у голштинов (локус ETH3 — аллель 127), и в 13,3%  —  у айрширов. С самой высокой частотой (58,4%) в группе животных айрширской породы выявлен аллель 115 локуса TGLA126. Полученные профили можно использовать в популяционных исследованиях и в практической работе по отнесению тех или иных групп скота к айрширской породе.\n The genetic structure of the subpopulation of the Ayrshire breed of cattle (n=600) was studied in a number of farms in the Krasnodar and Stavropol Territories by microsatellite loci: BM1818, BM1824, BM2113, ETH10, ETH225, ETH3, INRA023, SPS115, TGLA126, TGLA122, TGLA227, TGLA23. The number of homozygous and heterozygous animals according to the above loci, observed and expected heterozygosity, fixation index (Fis), breed-specific and frequently occurring alleles were determined. In the studied sample of Ayrshire cattle, on average, there was a minimal excess of heterozygotes (Fis=-0.03). It was established that alleles unique for the presented sample of the Ayrshire breed are: 184 (locus BM1824) - with a frequency of occurrence of 5.0%, 77 (TGLA227) — with a frequency of occurrence of 2.0%, 180 (TGLA53) — with a frequency of occurrence of 0.3 %, 222 (INRA023) with a frequency of 0.5%. In animals of the Ayrshire breed, an allelic variant was identified that was not found in Jerseys, but quite often in 15.7% of cases it was determined in Holsteins (the ETH3 locus is allele 127), and in 13.3% in Ayrshires. Allele 115 of the TGLA126 locus was identified with the highest frequency (58.4%) in the group of Ayrshire breed animals. The profiles obtained can be used in population studies and in practical work on assigning certain groups of cattle to the Ayrshire breed.","PeriodicalId":301520,"journal":{"name":"Molochnoe i miasnoe skotovodstvo","volume":"28 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2023-04-15","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":"{\"title\":\"GENETIC STRUCTURE OF THE AIRSHIERE CATTLE SUBPOPULATION IN THE SOUTHERN REGIONS OF RUSSIA BY MICROSATELLITE LOCUS\",\"authors\":\"Н.В. Ковалюк, Л.И. Якушева, Ю.Ю. Шахназарова, А.Е. Волченко\",\"doi\":\"10.33943/mms.2023.13.47.001\",\"DOIUrl\":null,\"url\":null,\"abstract\":\"Изучена генетическая структура субпопуляции айрширской породы крупного рогатого скота (n=600) в ряде хозяйств Краснодарского и Ставропольского краев по микросателлитным локусам: BM1818, BM1824, BM2113, ETH10, ETH225, ETH3, INRA023, SPS115, TGLA126, TGLA122, TGLA227, TGLA53. Определены количество гомозиготных и гетерозиготных животных по обозначенным выше локусам, наблюдаемая и ожидаемая гетерозиготность, индекс фиксации (Fis), породоспецифичные и часто встречающиеся аллели. В исследуемой выборке айрширского скота в среднем наблюдался минимальный излишек гетерозигот (Fis=-0,03). Установлено, что уникальными для представленной выборки айрширской породы являются аллели: 184 (локус BM1824) — с частотой встречаемости 5,0%, 77 (TGLA227) — с частотой встречаемости 2,0%, 180 (TGLA53) — с частотой встречаемости 0,3%, 222 (INRA023) — с частотой встречаемости 0,5%. У животных айрширской породы выявлен аллельный вариант, который не обнаружен у джерсеев, но достаточно часто в 15,7% случаев определялся у голштинов (локус ETH3 — аллель 127), и в 13,3%  —  у айрширов. С самой высокой частотой (58,4%) в группе животных айрширской породы выявлен аллель 115 локуса TGLA126. Полученные профили можно использовать в популяционных исследованиях и в практической работе по отнесению тех или иных групп скота к айрширской породе.\\n The genetic structure of the subpopulation of the Ayrshire breed of cattle (n=600) was studied in a number of farms in the Krasnodar and Stavropol Territories by microsatellite loci: BM1818, BM1824, BM2113, ETH10, ETH225, ETH3, INRA023, SPS115, TGLA126, TGLA122, TGLA227, TGLA23. The number of homozygous and heterozygous animals according to the above loci, observed and expected heterozygosity, fixation index (Fis), breed-specific and frequently occurring alleles were determined. In the studied sample of Ayrshire cattle, on average, there was a minimal excess of heterozygotes (Fis=-0.03). It was established that alleles unique for the presented sample of the Ayrshire breed are: 184 (locus BM1824) - with a frequency of occurrence of 5.0%, 77 (TGLA227) — with a frequency of occurrence of 2.0%, 180 (TGLA53) — with a frequency of occurrence of 0.3 %, 222 (INRA023) with a frequency of 0.5%. In animals of the Ayrshire breed, an allelic variant was identified that was not found in Jerseys, but quite often in 15.7% of cases it was determined in Holsteins (the ETH3 locus is allele 127), and in 13.3% in Ayrshires. Allele 115 of the TGLA126 locus was identified with the highest frequency (58.4%) in the group of Ayrshire breed animals. The profiles obtained can be used in population studies and in practical work on assigning certain groups of cattle to the Ayrshire breed.\",\"PeriodicalId\":301520,\"journal\":{\"name\":\"Molochnoe i miasnoe skotovodstvo\",\"volume\":\"28 1\",\"pages\":\"0\"},\"PeriodicalIF\":0.0000,\"publicationDate\":\"2023-04-15\",\"publicationTypes\":\"Journal Article\",\"fieldsOfStudy\":null,\"isOpenAccess\":false,\"openAccessPdf\":\"\",\"citationCount\":\"0\",\"resultStr\":null,\"platform\":\"Semanticscholar\",\"paperid\":null,\"PeriodicalName\":\"Molochnoe i miasnoe skotovodstvo\",\"FirstCategoryId\":\"1085\",\"ListUrlMain\":\"https://doi.org/10.33943/mms.2023.13.47.001\",\"RegionNum\":0,\"RegionCategory\":null,\"ArticlePicture\":[],\"TitleCN\":null,\"AbstractTextCN\":null,\"PMCID\":null,\"EPubDate\":\"\",\"PubModel\":\"\",\"JCR\":\"\",\"JCRName\":\"\",\"Score\":null,\"Total\":0}","platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Molochnoe i miasnoe skotovodstvo","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.33943/mms.2023.13.47.001","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
引用次数: 0

摘要

研究了克拉斯诺达尔和斯塔夫罗波尔少数族群(n=600)的遗传结构:BM1818、BM1824、BM2113、以太网、以太网、以太网、以太网、以太网、以太网、以太网、以太网、以太网、ps123、TGLA126、TGLA122、tgla253。= =特征= =根据上述特征,确定了同性恋和异质动物的数量、观察和预期的异质、固定指数(Fis)、原产地和常见的等位基因。在对爱尔兰牲畜的研究中,平均检测到微量的异质激素(Fis= 0.03)。爱尔兰岩石样本的独特特征是等位基因:184 (BM1824),频率为5.0%,频率为77 (TGLA227),频率为0.3%,频率为222 (INRA023),频率为0.5%。在耶尔赛人身上发现了等位基因,但在许多情况下,15.7%的病例是由格尔斯汀(以太3 - 127等位基因)和13.3%的爱尔兰人发现的。以最高的频率(58.4%),在一组动物中发现了115个TGLA126等位基因。获得的资料可以用于种群研究和将一组或另一组牲畜纳入爱尔兰品种的实际工作。在卡茨诺德和斯塔夫罗波(n=600)是由微satellite (BM1818、bm2124、bm225、以太网、以太网、以太网、以太网、TGLA126、tgla222、tgla223、tgla223和tgla223组成的农场组成的。homozygous和heterozygos的数字,观察和探索heterozysity, fixation index (Fis), breed-specific和frequently othermined的数字。在Ayrshire cattle工作室,在average,有一个小型的活动。It was established that alleles unique for the presented sample of the Ayrshire breed are: 184 (locus BM1824) with a frequency of occurrence of 5.0%, 77 (;) TGLA227 with a occurrence of 2.0%, 180 (TGLA53 frequency)占with a frequency of occurrence of 0.3, 222 (INRA023) with a frequency of 0.5%。在Ayrshire breed,那不是杰西的动物,但在157%的箱子里,那是霍尔斯坦的尸体,在Ayrshires的13.3%。在Ayrshire breed动物群中,115只locus被认为与最高的野生动物(58.4%)在一起。在流行工作室里,被蒙住眼睛的人可能会被蒙住眼睛,在音乐学院的赞助下表演。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
GENETIC STRUCTURE OF THE AIRSHIERE CATTLE SUBPOPULATION IN THE SOUTHERN REGIONS OF RUSSIA BY MICROSATELLITE LOCUS
Изучена генетическая структура субпопуляции айрширской породы крупного рогатого скота (n=600) в ряде хозяйств Краснодарского и Ставропольского краев по микросателлитным локусам: BM1818, BM1824, BM2113, ETH10, ETH225, ETH3, INRA023, SPS115, TGLA126, TGLA122, TGLA227, TGLA53. Определены количество гомозиготных и гетерозиготных животных по обозначенным выше локусам, наблюдаемая и ожидаемая гетерозиготность, индекс фиксации (Fis), породоспецифичные и часто встречающиеся аллели. В исследуемой выборке айрширского скота в среднем наблюдался минимальный излишек гетерозигот (Fis=-0,03). Установлено, что уникальными для представленной выборки айрширской породы являются аллели: 184 (локус BM1824) — с частотой встречаемости 5,0%, 77 (TGLA227) — с частотой встречаемости 2,0%, 180 (TGLA53) — с частотой встречаемости 0,3%, 222 (INRA023) — с частотой встречаемости 0,5%. У животных айрширской породы выявлен аллельный вариант, который не обнаружен у джерсеев, но достаточно часто в 15,7% случаев определялся у голштинов (локус ETH3 — аллель 127), и в 13,3%  —  у айрширов. С самой высокой частотой (58,4%) в группе животных айрширской породы выявлен аллель 115 локуса TGLA126. Полученные профили можно использовать в популяционных исследованиях и в практической работе по отнесению тех или иных групп скота к айрширской породе. The genetic structure of the subpopulation of the Ayrshire breed of cattle (n=600) was studied in a number of farms in the Krasnodar and Stavropol Territories by microsatellite loci: BM1818, BM1824, BM2113, ETH10, ETH225, ETH3, INRA023, SPS115, TGLA126, TGLA122, TGLA227, TGLA23. The number of homozygous and heterozygous animals according to the above loci, observed and expected heterozygosity, fixation index (Fis), breed-specific and frequently occurring alleles were determined. In the studied sample of Ayrshire cattle, on average, there was a minimal excess of heterozygotes (Fis=-0.03). It was established that alleles unique for the presented sample of the Ayrshire breed are: 184 (locus BM1824) - with a frequency of occurrence of 5.0%, 77 (TGLA227) — with a frequency of occurrence of 2.0%, 180 (TGLA53) — with a frequency of occurrence of 0.3 %, 222 (INRA023) with a frequency of 0.5%. In animals of the Ayrshire breed, an allelic variant was identified that was not found in Jerseys, but quite often in 15.7% of cases it was determined in Holsteins (the ETH3 locus is allele 127), and in 13.3% in Ayrshires. Allele 115 of the TGLA126 locus was identified with the highest frequency (58.4%) in the group of Ayrshire breed animals. The profiles obtained can be used in population studies and in practical work on assigning certain groups of cattle to the Ayrshire breed.
求助全文
通过发布文献求助,成功后即可免费获取论文全文。 去求助
来源期刊
自引率
0.00%
发文量
0
×
引用
GB/T 7714-2015
复制
MLA
复制
APA
复制
导出至
BibTeX EndNote RefMan NoteFirst NoteExpress
×
提示
您的信息不完整,为了账户安全,请先补充。
现在去补充
×
提示
您因"违规操作"
具体请查看互助需知
我知道了
×
提示
确定
请完成安全验证×
copy
已复制链接
快去分享给好友吧!
我知道了
右上角分享
点击右上角分享
0
联系我们:info@booksci.cn Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。 Copyright © 2023 布克学术 All rights reserved.
京ICP备2023020795号-1
ghs 京公网安备 11010802042870号
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:604180095
Book学术官方微信