蛋白质 β -折叠二聚体结合能的理论研究

Abstract

使用B3LYP和MP2方法研究了17个由甘氨酸多肽构成的具有反平行结构和平行结构的 β -折叠二聚体. 估算了在反平行结构中存在的H…H, O…O二级静电排斥作用的大小. 并以LR, SR, MR为结构单元探讨了肽链长度的增加对体系的结合能的影响. 结果表明在反平行的 β -折叠二聚体中, 由于二级静电作用的影响, 随着肽链长度的增加, 体系的结合能是以折线形式增强的, 而在平行结构中, 体系的结合能随着肽链长度的增加呈线性增强关系.