分子动力学模拟研究两性离子结构对聚13丙氨酸(polyalanine13)在水溶液中天然行为的维持

Abstract

用分子动力学方法模拟了水溶液中聚13丙氨酸分子(A13)由α-螺旋二级结构(α-helix )向无规线团(radom coil)转变的初期过程, 以及同样条件下A13分子分别与两性离子材料表面和疏水性材料表面作用的行为. 二级结构分析、氢键分析、均方根偏移、二面角分布和吸附程度分析结果显示, 两性离子材料表面对在水环境中A13分子的正常行为影响较小. 间接证明了“维持正常构象”假说.