Hepatosellüler karsinomda miR-4746'nın klinik önemi, kestirim değeri ve ifadesi için veri tabanı madenciliği

Zekiye Altan, Yunus Şahi̇n, Aydın Karabulut, A. Arslan
{"title":"Hepatosellüler karsinomda miR-4746'nın klinik önemi, kestirim değeri ve ifadesi için veri tabanı madenciliği","authors":"Zekiye Altan, Yunus Şahi̇n, Aydın Karabulut, A. Arslan","doi":"10.31832/smj.1187165","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Amaç: MikroRNA'lar, hepatosellüler karsinomun (HCC) gelişiminde ve ilerlemesinde anahtar düzenleyicilerdir. Yakın tarihli bir çalışmada, miR-4746'nın HCC’de aşırı ifade edildiği bulunmuş olsa da miR-4746’nın HCC’deki farklı seviyelerde ifade edilmesi ve klinikopatolojik önemi belirsizliğini korumaktadır. Bu çalışmada miR-4746’nın gen ifade özelliğini, klinikopatolojik rolünü ve kestirim değerini hesaplamalı yaklaşımlar kullanarak değerlendirmeyi amaçladık. \n \nGereç ve Yöntemler: Çeşitli insan kanserlerinde miR-4746’nın gen ifade özelliği dbDEMC veri tabanı kullanılarak belirlendi. Ayrıca, HCC’de miR-4746 gen ifade seviyesini analiz etmek için ENCORI/Starbase v2 ve UALCAN veri tabanlarını kullandık. Ayrıca UALCAN veri tabanını kullanarak miR-4746’nın klinikopatolojik işlevini araştırdık. Son olarak, miR-4746’nın HCC’deki kestirim özelliğini belirleyebilmek için Kaplan-Meier plotter ve ENCORI/Starbase v2 veri tabanları aracılığıyla sağ kalım analizi ile gerçekleştirdik. \n \nBulgular: miR-4746, çeşitli insan kanserlerinde farklı gen ifade değerlerine sahipti ve normal örneklere kıyasla HCC dokularında önemli ölçüde arttığı gözlemlenmiştir. Klinikopatolojik analiz, miR-4746’nın kanser evresi, tümör derecesi, lenf bezi metastaz durumu, TP53 mutasyon durumu ve hastanın yaşı dahil olmak üzere farklı klinik parametrelerde farklı gen ifade seviyelerine sahip olduğunu koydu. Ek olarak, miR-4746’nın yüksek ifadesi, HCC’de kötü prognoz ile önemli ölçüde ilişkili olduğu bulunmuştur. \n \nSonuç: Bulgularımız, miR-4746’nın kötü kestirim ve çok kötü klinikopatolojik çıktılarla ilişkilendirilen onkojenik bir miRNA olabileceğini gösterdi. Ayrıca miR-4746, HCC’nin tümorogenezinde önemli bir role sahip olabilir ve potansiyel kestirim biyobelirteç olarak hizmet edebilir.","PeriodicalId":21405,"journal":{"name":"Sakarya Medical Journal","volume":"2 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2023-03-06","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Sakarya Medical Journal","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.31832/smj.1187165","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
引用次数: 0

Abstract

Amaç: MikroRNA'lar, hepatosellüler karsinomun (HCC) gelişiminde ve ilerlemesinde anahtar düzenleyicilerdir. Yakın tarihli bir çalışmada, miR-4746'nın HCC’de aşırı ifade edildiği bulunmuş olsa da miR-4746’nın HCC’deki farklı seviyelerde ifade edilmesi ve klinikopatolojik önemi belirsizliğini korumaktadır. Bu çalışmada miR-4746’nın gen ifade özelliğini, klinikopatolojik rolünü ve kestirim değerini hesaplamalı yaklaşımlar kullanarak değerlendirmeyi amaçladık. Gereç ve Yöntemler: Çeşitli insan kanserlerinde miR-4746’nın gen ifade özelliği dbDEMC veri tabanı kullanılarak belirlendi. Ayrıca, HCC’de miR-4746 gen ifade seviyesini analiz etmek için ENCORI/Starbase v2 ve UALCAN veri tabanlarını kullandık. Ayrıca UALCAN veri tabanını kullanarak miR-4746’nın klinikopatolojik işlevini araştırdık. Son olarak, miR-4746’nın HCC’deki kestirim özelliğini belirleyebilmek için Kaplan-Meier plotter ve ENCORI/Starbase v2 veri tabanları aracılığıyla sağ kalım analizi ile gerçekleştirdik. Bulgular: miR-4746, çeşitli insan kanserlerinde farklı gen ifade değerlerine sahipti ve normal örneklere kıyasla HCC dokularında önemli ölçüde arttığı gözlemlenmiştir. Klinikopatolojik analiz, miR-4746’nın kanser evresi, tümör derecesi, lenf bezi metastaz durumu, TP53 mutasyon durumu ve hastanın yaşı dahil olmak üzere farklı klinik parametrelerde farklı gen ifade seviyelerine sahip olduğunu koydu. Ek olarak, miR-4746’nın yüksek ifadesi, HCC’de kötü prognoz ile önemli ölçüde ilişkili olduğu bulunmuştur. Sonuç: Bulgularımız, miR-4746’nın kötü kestirim ve çok kötü klinikopatolojik çıktılarla ilişkilendirilen onkojenik bir miRNA olabileceğini gösterdi. Ayrıca miR-4746, HCC’nin tümorogenezinde önemli bir role sahip olabilir ve potansiyel kestirim biyobelirteç olarak hizmet edebilir.
求助全文
约1分钟内获得全文 求助全文
来源期刊
自引率
0.00%
发文量
0
×
引用
GB/T 7714-2015
复制
MLA
复制
APA
复制
导出至
BibTeX EndNote RefMan NoteFirst NoteExpress
×
提示
您的信息不完整,为了账户安全,请先补充。
现在去补充
×
提示
您因"违规操作"
具体请查看互助需知
我知道了
×
提示
确定
请完成安全验证×
copy
已复制链接
快去分享给好友吧!
我知道了
右上角分享
点击右上角分享
0
联系我们:info@booksci.cn Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。 Copyright © 2023 布克学术 All rights reserved.
京ICP备2023020795号-1
ghs 京公网安备 11010802042870号
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:481959085
Book学术官方微信