Struktur Genom Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus-2 (SARS-CoV-2)

JURNAL BIOMEDIK (JBM) Pub Date : 2021-03-29 DOI:10.35790/jbm.13.2.2021.31996

Ren Minggu, J. M. Rumbajan, Grace L. A. Turalaki

{"title":"Struktur Genom Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus-2 (SARS-CoV-2)","authors":"Ren Minggu, J. M. Rumbajan, Grace L. A. Turalaki","doi":"10.35790/jbm.13.2.2021.31996","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Abstract: The genome sequencing as well as the protein structure and function of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) is known and helps in structurally characterizing viral proteins, determining evolutionary trajectories, identifying interactions with host proteins and providing biological insights. Knowledge of the structure of the SARS-CoV-2 genome is useful as a means of understanding the disease coronavirus disease 19 (COVID-19). This study aims to determine the genome structure of SARS-CoV-2. This study is a literature review, which was conducted on 23 literatures. This study showed that 23 literatures obtained, as many as in journals suggesting the structure of the genome, there are ORF (open reading frame) / NSP (non-structural protein) and structural protein, namely: S (spike, glycoprotein), E (Envelope), M (Membrane) and N (nucleocapsid) while the remaining 5 literatures do not discuss this structure. The result of this study showed that the genome structure of SARS-CoV-2 consisted of structural proteins, namely; glycoprotein (S), envelope protein (E), membrane protein (M), and nucleocapsid protein (N) and non-structural protein (NSP) encoded by ORF1a and ORF1b via two polyproteins pp1a and pp1b.Keywords: Genome, SARS-CoV-2 Abstrak: Urutan genom serta struktur dan fungsi protein dari severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) telah diketahui dan membantu dalam mengkarakterisasi protein virus secara struktural, menentukan lintasan evolusi, mengidentifikasi interaksi dengan protein inang dan memberikan wawasan biologi. Pengetahuan tentang struktur genom SARS-CoV-2 ini bermanfaat sebagai pengetahuan memahami penyakit coronavirus disease 19 (COVID-19). Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui struktur genom SARS-CoV-2. Penelitian ini merupakan penelitian yang bersifat literature review, yang dilakukan terhadap 23 literatur yang memenuhi kriteria inklusi dan eksklusi dari penelitian ini. Penelitian ini menunjukkan bahwa 23 literatur yang didapat, sebanyak pada 18 jurnal mengemukakan tentang struktur genom terdapat ORF (open reading frame)/NSP (Non-Struktural Protein) dan protein struktural yaitu : S (lonjakan, glikoprotein), E (Envelope), M (Membran) dan N (Nukleocapsid) sedangkan sisanya terdapat 5 jurnal tidak membahas struktur tersebut. Hasil penelitian ini menunjukan bahwa struktur genom SARS-CoV-2 terdiri atas protein struktural yaitu; glikoprotein (S), protein amplop (E), protein membran (M), dan protein nuckleokapsid dan protein non-struktural (NSP) yang di kodekan oleh ORF1a dan ORF1b melalui dua poliprotein pp1a dan pp1b.Kata Kunci: Genome, SARS-CoV-2","PeriodicalId":17726,"journal":{"name":"JURNAL BIOMEDIK (JBM)","volume":"69 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2021-03-29","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"JURNAL BIOMEDIK (JBM)","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.35790/jbm.13.2.2021.31996","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}

引用次数: 0

Abstract

Abstract: The genome sequencing as well as the protein structure and function of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) is known and helps in structurally characterizing viral proteins, determining evolutionary trajectories, identifying interactions with host proteins and providing biological insights. Knowledge of the structure of the SARS-CoV-2 genome is useful as a means of understanding the disease coronavirus disease 19 (COVID-19). This study aims to determine the genome structure of SARS-CoV-2. This study is a literature review, which was conducted on 23 literatures. This study showed that 23 literatures obtained, as many as in journals suggesting the structure of the genome, there are ORF (open reading frame) / NSP (non-structural protein) and structural protein, namely: S (spike, glycoprotein), E (Envelope), M (Membrane) and N (nucleocapsid) while the remaining 5 literatures do not discuss this structure. The result of this study showed that the genome structure of SARS-CoV-2 consisted of structural proteins, namely; glycoprotein (S), envelope protein (E), membrane protein (M), and nucleocapsid protein (N) and non-structural protein (NSP) encoded by ORF1a and ORF1b via two polyproteins pp1a and pp1b.Keywords: Genome, SARS-CoV-2 Abstrak: Urutan genom serta struktur dan fungsi protein dari severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) telah diketahui dan membantu dalam mengkarakterisasi protein virus secara struktural, menentukan lintasan evolusi, mengidentifikasi interaksi dengan protein inang dan memberikan wawasan biologi. Pengetahuan tentang struktur genom SARS-CoV-2 ini bermanfaat sebagai pengetahuan memahami penyakit coronavirus disease 19 (COVID-19). Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui struktur genom SARS-CoV-2. Penelitian ini merupakan penelitian yang bersifat literature review, yang dilakukan terhadap 23 literatur yang memenuhi kriteria inklusi dan eksklusi dari penelitian ini. Penelitian ini menunjukkan bahwa 23 literatur yang didapat, sebanyak pada 18 jurnal mengemukakan tentang struktur genom terdapat ORF (open reading frame)/NSP (Non-Struktural Protein) dan protein struktural yaitu : S (lonjakan, glikoprotein), E (Envelope), M (Membran) dan N (Nukleocapsid) sedangkan sisanya terdapat 5 jurnal tidak membahas struktur tersebut. Hasil penelitian ini menunjukan bahwa struktur genom SARS-CoV-2 terdiri atas protein struktural yaitu; glikoprotein (S), protein amplop (E), protein membran (M), dan protein nuckleokapsid dan protein non-struktural (NSP) yang di kodekan oleh ORF1a dan ORF1b melalui dua poliprotein pp1a dan pp1b.Kata Kunci: Genome, SARS-CoV-2

查看原文本刊更多论文

严重急性呼吸综合征冠状病毒-2 (SARS-CoV-2)

摘要:SARS-CoV-2的基因组测序、蛋白质结构和功能已被了解，这有助于从结构上表征病毒蛋白，确定进化轨迹，确定与宿主蛋白的相互作用，并提供生物学见解。了解SARS-CoV-2基因组的结构有助于了解冠状病毒病19 (COVID-19)。本研究旨在确定SARS-CoV-2的基因组结构。本研究为文献综述，共纳入23篇文献。本研究发现，获得的23篇文献，与期刊上的文献一样多，表明基因组的结构有ORF (open reading frame) / NSP (non-structural protein)和结构蛋白，即S (spike，糖蛋白)、E (Envelope)、M (Membrane)和N (nucleocapsid)，而其余5篇文献没有讨论这种结构。本研究结果表明，SARS-CoV-2的基因组结构由结构蛋白组成，即;ORF1a和ORF1b通过两个多蛋白pp1a和pp1b编码糖蛋白(S)、包膜蛋白(E)、膜蛋白(M)、核衣壳蛋白(N)和非结构蛋白(NSP)。摘要:乌鲁顿基因组、严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(SARS-CoV-2)、冠状病毒2型(SARS-CoV-2)、冠状病毒2型(SARS-CoV-2)、冠状病毒1型(SARS-CoV-2)、冠状病毒2型(SARS-CoV-2)、冠状病毒2型(SARS-CoV-2)、冠状病毒2型(SARS-CoV-2)、冠状病毒2型(SARS-CoV-2)、冠状病毒2型(SARS-CoV-2)、冠状病毒2型(SARS-CoV-2)、冠状病毒2型(SARS-CoV-2)、冠状病毒2型(SARS-CoV-2)、冠状病毒2型(SARS-CoV-2)。冠状病毒病(COVID-19)SARS-CoV-2基因结构分析。Penelitian ini merupakan Penelitian yang bersifat文献综述，yang dilakukan terhadap 23篇文献yang memenuhi标准inklusi和eksklusi dari Penelitian ini。Penelitian ini menunjukkan bahwa 23篇文献，sebanyak paada 18篇期刊mengemukakan tentang strucktur genome terdapat ORF (open reading frame)/NSP (non - structural Protein) dan Protein structure yitu: S (lonjakan, glikoprotein)， E (Envelope)， M (membrane) dan N (Nukleocapsid) sedangkan sisanya terdapat 5篇期刊tidak membahas strucktur tersebut。SARS-CoV-2 terdii - ata蛋白结构图谱的研究糖样蛋白(S)、蛋白倍体(E)、蛋白膜(M)、蛋白核壳壳体蛋白非结构性(NSP)Kata Kunci:基因组，SARS-CoV-2

本文章由计算机程序翻译，如有差异，请以英文原文为准。

求助全文

约1分钟内获得全文求助全文

来源期刊

JURNAL BIOMEDIK (JBM)

自引率

0.00%

发文量