Identificação de cianobactérias na Lagoa Salgada por abordagem metagenômica, Rio de Janeiro, Brasil

IF 0.1 Q4 AGRICULTURE, MULTIDISCIPLINARY
Thiago Corrêa de Almeida, Rodrigo Jardim Monteiro Fonseca, P. G. Moura, Elvira Carvajal, Nelson Peixoto Kotowski-Filho, A. Sotero-Martins
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Abstract

A Lagoa Salgada é um corpo aquático hipersalino costeiro localizado no norte do Estado do Rio de Janeiro e reconhecido pela presença de estromatólitos. As cianobactérias são os principais produtores primários dessas estruturas em lagoas hipersalinas costeiras. O objetivo do estudo foi identificar as cianobactérias presentes na Lagoa Salgada por meio da metagenômica. O material genético obtido de uma amostra de água coletada no mês de junho de 2019 foi submetido ao sequenciamento pelo método shotgun. Os dados metagenômicos foram analisados utilizando o pipeline MetaWrap versão 1.3 para identificação das cianobactérias e dos processos biológicos. O gênero Synechococcus apresentou maior abundância correspondendo por 64,3% das cianobactérias identificadas, seguidos por Synechocystis (23,6%), Geminocystis (2%) e Calothrix (1,8%). As espécies mais abundantes foram Synechococcus sp. RS9909 (46,7%), Synechocystis sp. PCC 6714 (16,4%), Synechococcus sp. WH 8101 (9,2%), Synechocystis sp. CACIAM 05 (4,3%). Foram identificados 33 processos biológicos associados aos genes presentes na amostra. A Lagoa Salgada apresenta uma ampla diversidade de cianobactérias em seu ecossistema aquático ainda pouco explorado, fundamentando a necessidade de proteção e preservação deste ambiente lagunar. 
用宏基因组学方法鉴定盐湖蓝藻,巴西里约热内卢
Lagoa Salgada是一个位于里约热内卢州北部的沿海高盐度水体,因存在叠层石而闻名。蓝藻是沿海高盐泻湖中这些结构的主要主要生产者。该研究的目的是通过宏基因组学鉴定拉戈阿-萨尔加达存在的蓝藻。从2019年6月采集的水样中获得的遗传物质通过霰弹枪法进行测序。使用MetaWrap管道1.3版分析宏基因组数据,以确定蓝藻和生物过程。聚球藻属的丰度更高,占已鉴定蓝藻的64.3%,其次是聚球藻(23.6%)、双孢子虫(2%)和卡氏藻(1.8%)。最丰富的物种是聚球藻RS9909(46.7%)、聚囊藻PCC 6714(16.4%)、聚球藻WH 8101(9.2%)和聚囊藻CACIAM 05(4.3%)。我们鉴定了33个与样本中存在的基因相关的生物过程。Lagoa Salgada在其尚未被探索的水生生态系统中呈现出广泛的蓝藻多样性,证明了保护和保存该泻湖环境的必要性。
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