Análisis filogenético del gen Spike del virus de la diarrea epidémica porcina en Colombia, 2014-2015

Abstract

Se reportaron brotes de diarrea epidémica porcina en Colombia durante 2014-2015. En el presente análisis, se descargaron secuencias de nucleótidos completas del Genbank para el gen Spike de las cepas del virus de la diarrea epidémica porcina (PEDV) reportadas en Colombia. En el árbol filogenético basado en proteínas de espiga de PEDV, las cepas de Colombia se agruparon en los genotipos G2a y S-INDEL, las cepas mostraron alta homología (> 99,9%) con cepas de Estados Unidos (Colorado / 2013, OH851), como así como inserciones y deleciones en el dominio S1 del gen Spike presente tanto en cepas colombianas como en cepas de referencia. Se han identificado varias sustituciones de aminoácidos en los epítopos neutralizantes de las cepas colombianas en comparación con la cepa de referencia CV777. Estos estudios podrían ayudar a rastrear las posibles rutas de introducción del PEDV en Colombia, reconocer las relaciones filogenéticas de las cepas que circulan en el país e implementar estrategias de control y prevención.