Identification of Malassezia species as part of normal skin and ear canal microbiota in horses

Abstract

Background: The yeasts of the genus Malassezia are considered part of the normal skin microbiota in humans and animals. In horses, several species of the genus Malassezia have been reported in different areas of the skin and ear canal. Objective: Isolate, characterize and identify the different species belonging to the genus Malassezia isolated from the ear canal and skin of equine patients with no dermatological lesions that were referred to the large animal clinic of veterinary teaching hospital at the National University of Colombia. Methods: 22 horses were evaluated and sampled. Eighty-two samples were obtained by swabbing either the ear canals (left and right), skin areas of prepuce, mammary gland and inguinal region. The samples were examined by cytological evaluation and were cultured on modified Dixon’s agar and phenotypic and molecular identification were performed for yeast colonies. Results: Fourteen yeast isolates were obtained from the 82 samples. Biochemical identification determined that 50% (n=7) were Malassezia spp., 35.7% (n=5) were identified as Candida spp. and 14.3% (n=2) as Cryptococcus spp. Using molecular tests, the Malassezia species were M. slooffiae (28.6%) and M. nana (57.1%); only one isolate was classified as Trichosporo asahii. Conclusion: M. nana and M. slooffiae were identified as part of the normal ear canal and skin microbiota in the evaluated horses. The observed prevalence of Malassezia spp. was 18.2% (n=4/22) in this study sample. Keywords: culture; ear canal; horses; identification; Malassezia ; normal microbiota; PCR; skin; yeast. Resumen Antecedentes: Las levaduras del genero Malassezia hacen parte de la microbiota normal cutanea de humanos y animales. En equinos se han reportado diferentes especies de Malassezia aisladas de varias regiones de piel y canal auditivo externo. Objetivo: Aislar, caracterizar e identificar las especies del genero Malassezia spp. a partir de canal auditivo externo y piel de equinos sin lesiones dermatologicas, remitidos a la Clinica de Grandes Animales de la Facultad de Medicina Veterinaria y de Zootecnia de la Universidad Nacional de Colombia. Metodos: Se evaluaron 22 equinos, a partir de los cuales se obtuvieron 82 muestras entre hisopados de canal auditivo externo (izquierdo y derecho) y diferentes regiones de piel (prepucio, glandula mamaria e ingle). Las muestras fueron procesadas mediante examen directo y cultivo en agar Dixon modificado. A partir de los aislamientos en los que se observaron colonias morfologicamente compatibles con Malassezia spp. se realizo la identificacion fenotipica y molecular. Resultados: De las 82 muestras procesadas se obtuvieron 14 aislamientos de levaduras, de las cuales (n=2) a Cryptococcus spp. Luego mediante pruebas moleculares se identificaron las especies del genero Malassezia como: M. slooffiae (28,6%) y M. nana (57,1%); y un aislamiento correspondio a Trichosporon asahii. Conclusion: Se logro identificar las especies M. nana y M. slooffiae como microbiota normal de la piel y el canal auditivo en los equinos evaluados. La prevalencia de Malassezia spp. para la poblacion evaluada fue de 18,2% (n=4/22). Palabras clave: canal auditivo; cultivo; equinos; identificacion; levaduras; Malassezia ; microbiota normal; PCR; piel. Resumo Antecedentes: As leveduras do genero Malassezia fazem parte da microbiota cutânea normal de humanos e animais. Em cavalos, diferentes especies de Malassezia isoladas de varias regioes da pele e do canal auditivo externo foram reproduzidas. Objetivo: Isolar, caracterizar e identificar as especies do genero Malassezia spp. do canal auditivo externo e pele equinos sem lesoes cutâneas, referiu-se a Clinica de Grandes Animais da Faculdade de Medicina Veterinaria e Zootecnia da Universidade Nacional da Colombia. Metodos: 22 equinos foram avaliadas a partir dos quais 82 amostras a partir de esfregacos do canal auditivo externo (esquerda e direita) e diferentes regioes da pele (prepucio, glândula mamaria e virilha) foram obtidos. As amostras foram processadas por exame direto e cultura em agar Dixon modificado. Dos isolados nos quais as colonias foram observadas morfologicamente compativeis com Malassezia spp. identificacao fenotipica e molecular foi realizada. Resultados: Das 82 amostras processadas 14 isolados de levedura, que foram obtidos por identificacao bioquimica de 50% (n=7) correspondia a Malassezia spp., 35,7% (n=5) a Candida spp., e 14,3% (n=2) para Cryptococcus spp.. Em seguida, usando o teste molecular especie Malassezia foram identificadas como M. slooffiae (28,6%) e M. nana (57,1%); e um isolamento correspondia a Trichosporon asahii. Conclusao: As especies M. nana e M. slooffiae foram identificadas como microbiota de pele normal e do canal auditivo nos equideos avaliados. A prevalencia de Malassezia spp. para a populacao avaliada foi 18,2% (n=4/22). Palavras-chave: canal auditivo; cavalos; cultivo; identificacao; levedura, Malassezia ; microbiota normal; PCR; pele.