Proteome-wide autoantibody screening and holistic autoantigenomic analysis unveil COVID-19 signature of autoantibody landscape.

IF 2.9 4区 医学 Q3 IMMUNOLOGY
Kazuki M Matsuda, Yoshiaki Kawase, Kazuhiro Iwadoh, Makoto Kurano, Yutaka Yatomi, Koh Okamoto, Kyoji Moriya, Hirohito Kotani, Teruyoshi Hisamoto, Ai Kuzumi, Takemichi Fukasawa, Asako Yoshizaki-Ogawa, Masanori Kono, Tomohisa Okamura, Hirofumi Shoda, Keishi Fujio, Kei Yamaguchi, Taishi Okumura, Chihiro Ono, Yuki Kobayashi, Ayaka Sato, Ayako Miya, Rikako Uchino, Yumi Murakami, Hiroshi Matsunaka, Hiroshi Imai, Shinichi Sato, Rudy Raymond, Ayumi Yoshizaki, Naoki Goshima
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蛋白质组自身抗体筛选和整体自身抗基因组分析揭示了COVID-19自身抗体景观的特征。
本研究提出了“自身抗体综合数据库(UT-ABCD)”,这是284个人类个体自身抗体谱的综合目录。研究对象包括诊断为2019冠状病毒病(COVID-19, n = 73)、系统性硬化症(SSc, n = 32)、系统性红斑狼疮(SLE, n = 60)、抗中性粒细胞细胞质抗体相关血管炎(AAV, n = 29)、特应性皮炎(AD, n = 26)以及健康对照(HC, n = 64)的患者。我们的研究采用蛋白质组自身抗体筛选(pwab),利用13352种自身抗原显示在湿蛋白阵列(wpa)上。我们的wpa展示了利用小麦无生殖细胞系统体外合成的人类蛋白质,保持在水合状态。我们的研究结果表明,与hc相比,COVID-19、SSc、SLE、AAV和AD中IgG自身抗体的数量显著增加,而COVID-19、SSc和SLE中IgG自身抗体水平的总和显著更高。利用机器学习,我们基于自身抗体谱对COVID-19病例进行了高精度的区分,特别是鉴定出针对BCORP1和KAT2A编码的蛋白质的抗体对COVID-19具有高度特异性(特异性分别为87%和97%)。我们的研究强调了pwab和自身抗基因组学在探索COVID-19和其他疾病免疫反应中的有效性。虽然没有进行外部验证和功能分析,但鉴定出的反应性代表了与COVID-19相关的血清学生物标志物和免疫特征,并为未来发现生物标志物提供了全面的资源。
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来源期刊
BMC Immunology
BMC Immunology 医学-免疫学
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1 months
期刊介绍: BMC Immunology is an open access journal publishing original peer-reviewed research articles in molecular, cellular, tissue-level, organismal, functional, and developmental aspects of the immune system as well as clinical studies and animal models of human diseases.
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GB/T 7714-2015
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