{"title":"Les urgences en microbiologie","authors":"Wafa Ben Nejma , Nadège Bourgeois-Nicolaos","doi":"10.1016/S1773-035X(25)76468-0","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"<div><h3>Résumé</h3><div>Les examens urgents en microbiologie jouent un rôle fondamental dans la prise en charge rapide des infections graves, notamment en milieu hospitalier. Ils permettent d’identifier rapidement l’agent infectieux responsable d’un tableau clinique aigu, tel qu’un sepsis, une méningite, ou une pneumonie sévère, et d’adapter précocement le traitement antimicrobien. Ces examens incluent notamment les hémocultures, les examens directs et cultures sur prélèvements stériles (liquide céphalo-rachidien (LCR), urine, pus), ainsi que les techniques de biologie moléculaire comme les <em>Polymerase Chain reaction</em> (PCR) virales (Influenza, Sars-CoV-2, <em>herpes simplex virus</em> (HSV), cytomégalovirus (CMV)). Leur réalisation doit être rigoureuse, en respectant les délais de prélèvement et de transport, afin d’optimiser la sensibilité diagnostique. En parallèle, certains examens sérologiques ou parasitologiques peuvent également être demandés en urgence, notamment chez les patients immunodéprimés ou revenant de zones endémiques. La collaboration étroite entre cliniciens et microbiologistes est essentielle pour garantir une interprétation rapide et pertinente des résultats, dans un objectif de prise en charge efficace et de limitation de la transmission infectieuse.</div></div><div><h3>Abstract</h3><div>Urgent microbiological tests play a crucial role in the rapid management of severe infections, particularly in hospital settings. They enable the prompt identification of the infectious agent responsible for acute clinical presentations such as sepsis, meningitis, or severe pneumonia, and allow for early adaptation of antimicrobial therapy. These tests include blood cultures, direct examinations and cultures from sterile site samples (cerebrospinal fluid, urine, pus), as well as molecular biology techniques such as viral PCRs (Influenza, Sars-CoV-2, HSV, CMV). Proper execution—including timely sampling and transport—is essential to maximize diagnostic accuracy. In parallel, certain serological or parasitological tests may also be required urgently, particularly in immunocompromised patients or those returning from endemic areas. Close collaboration between clinicians and microbiologists is essential to ensure rapid and accurate interpretation of results, aiming for effective treatment and prevention of infectious disease transmission.</div></div>","PeriodicalId":74728,"journal":{"name":"Revue francophone des laboratoires : RFL","volume":"2025 575","pages":"Pages 49-61"},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2025-09-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Revue francophone des laboratoires : RFL","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1773035X25764680","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
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Résumé
Les examens urgents en microbiologie jouent un rôle fondamental dans la prise en charge rapide des infections graves, notamment en milieu hospitalier. Ils permettent d’identifier rapidement l’agent infectieux responsable d’un tableau clinique aigu, tel qu’un sepsis, une méningite, ou une pneumonie sévère, et d’adapter précocement le traitement antimicrobien. Ces examens incluent notamment les hémocultures, les examens directs et cultures sur prélèvements stériles (liquide céphalo-rachidien (LCR), urine, pus), ainsi que les techniques de biologie moléculaire comme les Polymerase Chain reaction (PCR) virales (Influenza, Sars-CoV-2, herpes simplex virus (HSV), cytomégalovirus (CMV)). Leur réalisation doit être rigoureuse, en respectant les délais de prélèvement et de transport, afin d’optimiser la sensibilité diagnostique. En parallèle, certains examens sérologiques ou parasitologiques peuvent également être demandés en urgence, notamment chez les patients immunodéprimés ou revenant de zones endémiques. La collaboration étroite entre cliniciens et microbiologistes est essentielle pour garantir une interprétation rapide et pertinente des résultats, dans un objectif de prise en charge efficace et de limitation de la transmission infectieuse.
Abstract
Urgent microbiological tests play a crucial role in the rapid management of severe infections, particularly in hospital settings. They enable the prompt identification of the infectious agent responsible for acute clinical presentations such as sepsis, meningitis, or severe pneumonia, and allow for early adaptation of antimicrobial therapy. These tests include blood cultures, direct examinations and cultures from sterile site samples (cerebrospinal fluid, urine, pus), as well as molecular biology techniques such as viral PCRs (Influenza, Sars-CoV-2, HSV, CMV). Proper execution—including timely sampling and transport—is essential to maximize diagnostic accuracy. In parallel, certain serological or parasitological tests may also be required urgently, particularly in immunocompromised patients or those returning from endemic areas. Close collaboration between clinicians and microbiologists is essential to ensure rapid and accurate interpretation of results, aiming for effective treatment and prevention of infectious disease transmission.