一个30个基因的分类器区分低风险MDS HSPCs和健康HSPCs。

骨髓增生异常综合征（MDS）是一组以造血功能障碍、形态发育不良和遗传异质性为特征的恶性克隆性疾病1。低风险MDS （LR-MDS）包括IPSS-M患者，中低风险、低风险和极低风险2，中位生存期有限，为3至10年3。此外，人们对发现LR-MDS病理生理的翻译靶点越来越感兴趣。造血干细胞和祖细胞（HSPC）到骨髓分化谱内的克隆群体被广泛认为是MDS病理生理的主要贡献者4。对导致LR-MDS病理生理的细胞类型和谱系特异性状态的颗粒评估仍有待阐明。在这里，我们利用单细胞转录组学来表征LR-MDS中hspc -髓细胞分化景观的细胞状态。我们开发了一个30基因评分来分类LR-MDS的HSPCs，并确定了LR-MDS的新分子特征。我们评分中的基因提示水疱运输功能障碍，我们进一步解决了骨髓分化轴。囊泡运输相关途径的基因产物可能是LR-MDS合适的翻译靶点。摘要：我们利用单细胞转录组学来区分来自患者骨髓样本的低风险MDS细胞和健康细胞。采用网络分析和分类相结合的方法鉴定了30个基因特征，将MDS HSPCs与HD HSPCs区分开来。观察到与蛋白质翻译，促炎细胞因子产生和囊泡运输相关的途径上调。最后，我们根据hspc -髓细胞分化轴上的表达对这30个基因进行了分类，并强调了与囊泡运输成分相关的基因的不同表达模式。