Analyse transcriptomique des réseaux de régulation génique et des facteurs de transcription clés des tumeurs neuroendocrines pancréatiques

IF 2.9 3区医学 Q3 ENDOCRINOLOGY & METABOLISM

Annales d'endocrinologie Pub Date : 2025-09-15 DOI:10.1016/j.ando.2025.101864

A. Jannin Dr , G. Pawlak Dr , S. Aubert Pr , C. Villenet Mme , M. Figeac Dr , M. Elati Dr , E. Leteurtre Pr , S. Espiard Pr , C. Cardot-Bauters Dr , B. Chevalier Dr , F. Pattou Pr , C. Marciniak Dr , M. El Amrani Dr , F. El Hajbi Dr , I. Vanseunigen Dr , M.-C. Vantyghem Pr , C. Do Cao Dr , N. Jonckheere Dr , L. Coppin Dr

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Abstract

Les tumeurs neuroendocrines pancréatiques (TNEp) sont rares mais leur incidence est croissante. Elles présentent une grande hétérogénéité selon leurs caractéristiques génétiques, épigénétiques, leur statut sécrétoire et à leur capacité de prolifération. Les classifications actuelles (grade et stade selon l’OMS) ne permettent pas de saisir toute la complexité moléculaire de ces tumeurs, ce qui limite la personnalisation des traitements. Les analyses transcriptomiques pourraient offrir une meilleure compréhension de la biologie tumorale.

Objectif

Identifier les facteurs de transcription (FT) jouant un rôle de régulateurs maîtres dans les TNEp, afin de mieux comprendre leurs caractéristiques phénotypiques.

Méthodologie

L’algorithme h-LICORN a été utilisé pour reconstruire un réseau de régulation à partir des transcriptomes de 63 échantillons de TNEp, en s’appuyant sur une liste de FT et co-FT. Ce réseau a ensuite été converti en réseau de corégulation (CoRegNet-TNEp) via le package CoRegNet.

Résultats

Trois sous-types tumoraux distincts ont été identifiés :

– C1 : surexpression de gènes liés au spliceosome et protéasome, enrichi en mutations MEN1.

– C2 : gènes associés à la transition épithélio-mésenchymateuse, aux fibroblastes tumoraux et à l’angiogenèse, corrélé à une maladie agressive.

– C3 : surexpression de gènes intervenant dans le métabolisme, prédominant chez les TNEp sécrétantes.

HER2 apparaît comme une cible potentielle dans les formes agressives.

Conclusion

Cette nouvelle approche nous a permis d’établir une nouvelle classification moléculaire des TNEp et d’identifier de nouveaux régulateurs clés qui sont des cibles thérapeutiques potentielles.

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胰腺神经内分泌肿瘤的基因调控网络和关键转录因子的转录分析

胰腺神经内分泌肿瘤（NEPs）很罕见，但发病率正在上升。根据遗传特征、表观遗传特征、分泌物状态和增殖能力，它们具有高度的异质性。目前的分类（根据世卫组织的等级和阶段）不能完全理解这些肿瘤的分子复杂性，这限制了治疗的个性化。转录组学分析可以提供对肿瘤生物学的更好理解。目的识别在TNEP中起主要调控作用的转录因子（FT），以便更好地了解它们的表型特征。利用h-LICORN算法，利用FT和co-FT列表，从63个TNEp样本的转录组重建调控网络。该网络随后通过CoRegNet包转换为CoRegNet-TNEp。三个不同的肿瘤亚型已被确定：—C1：经MEN1突变强化的螺旋体和蛋白酶体相关基因的过表达。- C2：与上皮-间充质转变、肿瘤成纤维细胞和血管生成相关的基因，与侵袭性疾病相关。- C3：参与代谢的基因过度表达，在分泌TNEP中占主导地位。HER2似乎是一个潜在的攻击目标。这种新方法使我们能够建立一个新的TNEP分子分类，并确定新的关键调控因子，这些调控因子是潜在的治疗靶点。

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来源期刊

Annales d'endocrinologie 医学-内分泌学与代谢

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审稿时长

50 days

期刊介绍： The Annales d''Endocrinologie, mouthpiece of the French Society of Endocrinology (SFE), publishes reviews, articles and case reports coming from clinical, therapeutic and fundamental research in endocrinology and metabolic diseases. Every year, it carries a position paper by a work-group of French-language endocrinologists, on an endocrine pathology chosen by the Society''s Scientific Committee. The journal is also the organ of the Society''s annual Congress, publishing a summary of the symposia, presentations and posters. "Les Must de l''Endocrinologie" is a special booklet brought out for the Congress, with summary articles that are always very well received. And finally, we publish the high-level instructional courses delivered during the Henri-Pierre Klotz International Endocrinology Days. The Annales is a window on the world, keeping alert clinicians up to date on what is going on in diagnosis and treatment in all the areas of our specialty.