Exploring HPV-linked head and neck cancer in Southern Punjab, Pakistan: Insights from HPV-16 phylogenetic analysis

IF 1.5 Q2 MEDICINE, GENERAL & INTERNAL

Journal of Taibah University Medical Sciences Pub Date : 2025-04-01 DOI:10.1016/j.jtumed.2025.03.001

Muhammad Kashif PhD , Sadia Minhas PhD , Shah Jahan PhD , Faheem Shahzad PhD , Romeeza Tahir PhD , Afia Abbas MSc , Muhammad Idrees PhD , Nadeem Afzal PhD

{"title":"Exploring HPV-linked head and neck cancer in Southern Punjab, Pakistan: Insights from HPV-16 phylogenetic analysis","authors":"Muhammad Kashif PhD , Sadia Minhas PhD , Shah Jahan PhD , Faheem Shahzad PhD , Romeeza Tahir PhD , Afia Abbas MSc , Muhammad Idrees PhD , Nadeem Afzal PhD","doi":"10.1016/j.jtumed.2025.03.001","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"<div><h3>أهداف البحث</h3><div>سرطان الخلايا الحرشفية في منطقة الرأس والرقبة هو مرض غير متجانس ويمكن تصنيفه إلى نوعين فرعيين: إيجابي لفيروس الورم الحليمي البشري (20%) وسلبي لفيروس الورم الحليمي البشري (80%). ومع ذلك، فإن انتشار النمط الجيني لفيروس الورم الحليمي البشري في باكستان غير معروف جيدا. تهدف هذه الدراسة إلى بحث مدى شيوع النمط الجيني لفيروس الورم الحليمي البشري-16 في مرضى سرطان الخلايا الحرشفية في منطقة جنوب البنجاب في باكستان وما هي السمات الجزيئية المحددة التي يظهرها هذا النمط الجيني.</div></div><div><h3>طرق البحث</h3><div>في هذه الدراسة المقطعية، جمع الباحثون 85 عينة أنسجة من حالات تم تشخيصها بسرطان الخلايا الحرشفية في منطقة الرأس والرقبة. لاستخراج الحمض النووي الجينومي، تم استخدام مقاطع الأنسجة المضمنة بالبارافين المثبتة بالفورمالين. وللكشف عن الحمض النووي لفيروس الورم الحليمي البشري، تم تضخيم المنطقة L1 باستخدام بادئات GP5+ وGP6+. تم استخدام تفاعل البوليميراز المتسلسل في الوقت الحقيقي لتحديد النمط الجيني لفيروس الورم الحليمي البشري عالي الخطورة. تم استخدام تسلسل الجينوم الكامل للتحليل التطوري والطفري لفيروس الورم الحليمي البشري-16.</div></div><div><h3>النتائج</h3><div>من بين 85 عينة، كانت 7.1% إيجابية لفيروس الورم الحليمي البشري، مع 4.7% إيجابية لفيروس الورم الحليمي البشري-16 و2.4% إيجابية لفيروس الورم الحليمي البشري-18. كما كان هناك ارتباط كبير بين فيروس الورم الحليمي البشري عالي الخطورة الإيجابي والدرجة النسيجية. كان جينوم فيروس الورم الحليمي البشري-16 في الدراسة وثيق الصلة بتلك الموجودة في تايلاند والولايات المتحدة والهند والصين وأوروبا، وتم الكشف عن إجمالي 11 طفرة في الجينوم، منها أربع طفرات جديدة.</div></div><div><h3>الاستنتاجات</h3><div>تشير نتائج الدراسة الحالية إلى انتشار نادر لسرطان الخلايا الحرشفية للرأس والرقبة المرتبط بفيروس الورم الحليمي البشري عالي الخطورة في باكستان. من خلال التحليل التطوري، تم اكتشاف أن جينوم فيروس الورم الحليمي البشري-16 المعزول في هذه الدراسة له بنية وراثية مميزة وكان له أيضا أوجه تشابه مع الجينومات المبلغ عنها من تايلاند والولايات المتحدة والهند والصين وأوروبا.</div></div>","PeriodicalId":46806,"journal":{"name":"Journal of Taibah University Medical Sciences","volume":"20 2","pages":"Pages 242-250"},"PeriodicalIF":1.5000,"publicationDate":"2025-04-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Journal of Taibah University Medical Sciences","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1658361225000307","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"Q2","JCRName":"MEDICINE, GENERAL & INTERNAL","Score":null,"Total":0}

引用次数: 0

Abstract

أهداف البحث

سرطان الخلايا الحرشفية في منطقة الرأس والرقبة هو مرض غير متجانس ويمكن تصنيفه إلى نوعين فرعيين: إيجابي لفيروس الورم الحليمي البشري (20%) وسلبي لفيروس الورم الحليمي البشري (80%). ومع ذلك، فإن انتشار النمط الجيني لفيروس الورم الحليمي البشري في باكستان غير معروف جيدا. تهدف هذه الدراسة إلى بحث مدى شيوع النمط الجيني لفيروس الورم الحليمي البشري-16 في مرضى سرطان الخلايا الحرشفية في منطقة جنوب البنجاب في باكستان وما هي السمات الجزيئية المحددة التي يظهرها هذا النمط الجيني.

طرق البحث

في هذه الدراسة المقطعية، جمع الباحثون 85 عينة أنسجة من حالات تم تشخيصها بسرطان الخلايا الحرشفية في منطقة الرأس والرقبة. لاستخراج الحمض النووي الجينومي، تم استخدام مقاطع الأنسجة المضمنة بالبارافين المثبتة بالفورمالين. وللكشف عن الحمض النووي لفيروس الورم الحليمي البشري، تم تضخيم المنطقة L1 باستخدام بادئات GP5+ وGP6+. تم استخدام تفاعل البوليميراز المتسلسل في الوقت الحقيقي لتحديد النمط الجيني لفيروس الورم الحليمي البشري عالي الخطورة. تم استخدام تسلسل الجينوم الكامل للتحليل التطوري والطفري لفيروس الورم الحليمي البشري-16.

النتائج

من بين 85 عينة، كانت 7.1% إيجابية لفيروس الورم الحليمي البشري، مع 4.7% إيجابية لفيروس الورم الحليمي البشري-16 و2.4% إيجابية لفيروس الورم الحليمي البشري-18. كما كان هناك ارتباط كبير بين فيروس الورم الحليمي البشري عالي الخطورة الإيجابي والدرجة النسيجية. كان جينوم فيروس الورم الحليمي البشري-16 في الدراسة وثيق الصلة بتلك الموجودة في تايلاند والولايات المتحدة والهند والصين وأوروبا، وتم الكشف عن إجمالي 11 طفرة في الجينوم، منها أربع طفرات جديدة.

الاستنتاجات

تشير نتائج الدراسة الحالية إلى انتشار نادر لسرطان الخلايا الحرشفية للرأس والرقبة المرتبط بفيروس الورم الحليمي البشري عالي الخطورة في باكستان. من خلال التحليل التطوري، تم اكتشاف أن جينوم فيروس الورم الحليمي البشري-16 المعزول في هذه الدراسة له بنية وراثية مميزة وكان له أيضا أوجه تشابه مع الجينومات المبلغ عنها من تايلاند والولايات المتحدة والهند والصين وأوروبا.

查看原文本刊更多论文

在巴基斯坦旁遮普南部探索hpv相关的头颈癌：来自HPV-16系统发育分析的见解

头部和颈部鳞状细胞癌研究目标是一种非单一疾病，可分为两类:人类乳头瘤病毒阳性(20%)和人类乳头瘤病毒阴性(80%)。然而，人类乳头瘤病毒的基因型在巴基斯坦的传播尚不清楚。这项研究的目的是研究人类乳头瘤病毒16的基因型在巴基斯坦旁遮普省南部的鳞状细胞癌患者中的流行程度，以及这种基因显示的具体分子特征。这项ct研究的研究方法，研究人员在头部和颈部地区采集了85个被诊断为鳞状细胞癌的组织样本。为了提取dna，使用了以福马林为基础的百草枯组织剖面图。为了检测人类乳头瘤病毒的dna，使用GP5+和gp6 +放大了L1。实时使用聚合酶链反应确定高风险人类乳头瘤病毒的基因型。对人类乳头瘤病毒16的发育和突变分析使用了整个基因组序列。在85份样本中，7.1%呈人乳头瘤病毒阳性，4.7%呈人乳头瘤病毒阳性-16呈阳性，2.4%呈人乳头瘤病毒18呈阳性。高正型和组织型人类乳头瘤病毒之间也存在很大关联。在研究中，人类乳头瘤病毒16的基因组与泰国、美国、印度、中国和欧洲的基因组密切相关，总共发现了11个基因突变，包括4个新的突变。本次研究的结果表明，巴基斯坦与高危险人类乳头瘤病毒有关的头和颈部鳞状细胞癌的发病率很低。通过进化分析，在本研究中分离出来的人类乳头瘤病毒16的基因组具有独特的遗传结构，并且与泰国、美国、印度、中国和欧洲报告的基因组相似。

本文章由计算机程序翻译，如有差异，请以英文原文为准。

求助全文

约1分钟内获得全文求助全文

来源期刊