Associations positives et négatives des virus respiratoires en soins primaires : étude ECOVIR

Abstract

Contexte & objectifs

Les infections respiratoires aiguës (IRA) sont les infections virales les plus courantes rencontrées en soins primaires. L’identification des virus responsables n’est toujours pas disponible en pratique courante. Bien que de nouvelles stratégies de prévention soient en disponibles, les connaissances sur les relations entre les virus respiratoires restent limitées.

Méthodes

ECOVIR était une étude prospective multicentrique réalisée en soins primaires pendant deux saisons avant la pandémie de SARS-CoV2 (2018–2019 et 2019–2020). Les patients de tous âges se présentant chez leur médecin généraliste (MG) avec des symptômes d’IRA ont été inclus. Dix-sept virus respiratoires ont été recherchés par RT-qPCR Multiplex réalisées sur des prélèvements nasopharyngés.

Résultats et discussion

Parmi les 668 échantillons analysés, 66 % étaient positifs pour au moins un virus, dont 7,9 % de codétections. La détection virale était négativement associée à l’âge des patients. Nous avons trouvé des corrélations entre le diagnostic clinique et les virus respiratoires: la grippe était significativement associée au diagnostic de syndrome pseudo-grippal (p < 0,001), le Rhinovirus au diagnostic de rhinite (p < 0,05), et le VRS aux diagnostics de bronchiolite (p < 0,001) et de bronchite (p < 0,05). Les codétections virales étaient significativement associées aux VRS, Rhinovirus, Bocavirus, Metapneumovirus, et Adenovirus, et non associées à la grippe, aux Coronavirus, et aux Para-Influenzae. Le Rhinovirus et la grippe étaient négativement associés à tous les virus. Inversement, une association positive a été trouvée entre Adenovirus et Bocavirus, et entre Para-Influenzae et Bocavirus.

Conclusions

Notre étude fournit des informations uniques sur les relations entre les virus respiratoires, qui restent très limitées concernant les soins primaires.