In silico screening of Hippophae rhamnoides polyphenols targeting the RhoA protein as a potential liver cancer treatment

IF 1.5 Q2 MEDICINE, GENERAL & INTERNAL

Journal of Taibah University Medical Sciences Pub Date : 2025-02-01 DOI:10.1016/j.jtumed.2025.01.006

Rukhsana Tabassum MS, Erum Dilshad PhD

{"title":"In silico screening of Hippophae rhamnoides polyphenols targeting the RhoA protein as a potential liver cancer treatment","authors":"Rukhsana Tabassum MS, Erum Dilshad PhD","doi":"10.1016/j.jtumed.2025.01.006","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"<div><h3>أهداف البحث</h3><div>نظرا لارتباط اشارات بروتينات \"آر اتش أو جي تي بيز\" المضطربة بسرطانات متعددة، يمكن بحثها كهدف محتمل لعلاجات سرطان الكبد. تعتبر نبتة العليق البحري من النباتات الطبية المهمة الموجودة في جبال قراقرم. ويعتقد باحتوائها على مركبات متعددة الفينول قادرة على تثبيط بروتين \"آر اتش أو – أ\"، مما قد يوفر تاثيرات مضادة لسرطان الكبد.</div></div><div><h3>طرق البحث</h3><div>تم تحديد المركبات متعددة الفينول في المستخلص الميثانولي للعليق البحري باستخدام التحليل الكروماتوغرافي السائل عالي الكفاءة ثم فحصها للتحري عن امكانياتها المضادة للسرطان عبر الارساء الجزيئي ومحاكاة الديناميكا الجزيئية ضد بروتين \"آر اتش أو – أ\". تم تحديد قيم الانحراف المتوسط الجذري التربيعي وقيم تقلب الجذر المتوسط المربع لكل مركب مختار، تبعها تحليل خصائص الامتصاص والتوزيع والتمثيل الغذائي والإفراز والسمية.</div></div><div><h3>النتائج</h3><div>وجدت المركبات متعددة الفينول حمض الغاليك وحمض الساليسيليك وحمض الكافيك والكيمفيرول والروتين والكيرستين والكومارين وحمض الفيروليك وحمض السينابيك وحمض النبق وحمض الفانيليك وحمض الكلوروجينيك في المستخلص الميثانولي للعليق البحري. بناء على قاعدة ليبنسكي الخماسية ودرجة فينا وحجم التجويف، تم اختيار خمسة روابط لمزيد من البحث حيث تظهر خصائص ملحوظة. وفقا لذلك، تبين حمض الكافيك كمركب بارز مع خصائص امتصاص وتوزيع وتمثيل غذائي وطرح وسمية جذابة ودرجة ارساء ونتائج محاكاة ديناميكية جزيئية مثالية.</div></div><div><h3>الاستنتاجات</h3><div>نظرا لبقائه سليما وارتباطه ببنية البروتين طوال فترة المحاكاة، مما يدل على تفاعل قوي بين البروتين والرابط ويشير لتاثير تثبيطي محتمل، قد يمتلك حمض الكافيك القدرة العظمى على تثبيط بروتين \"آر اتش أو – أ\". وبالتالي، مطلوب مزيد من البحث لدراسة حمض الكافيك كخيار دوائي محتمل للتطوير الدوائي المستقبلي.</div></div>","PeriodicalId":46806,"journal":{"name":"Journal of Taibah University Medical Sciences","volume":"20 1","pages":"Pages 89-106"},"PeriodicalIF":1.5000,"publicationDate":"2025-02-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Journal of Taibah University Medical Sciences","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S165836122500006X","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"Q2","JCRName":"MEDICINE, GENERAL & INTERNAL","Score":null,"Total":0}

引用次数: 0

Abstract

أهداف البحث

نظرا لارتباط اشارات بروتينات "آر اتش أو جي تي بيز" المضطربة بسرطانات متعددة، يمكن بحثها كهدف محتمل لعلاجات سرطان الكبد. تعتبر نبتة العليق البحري من النباتات الطبية المهمة الموجودة في جبال قراقرم. ويعتقد باحتوائها على مركبات متعددة الفينول قادرة على تثبيط بروتين "آر اتش أو – أ"، مما قد يوفر تاثيرات مضادة لسرطان الكبد.

طرق البحث

تم تحديد المركبات متعددة الفينول في المستخلص الميثانولي للعليق البحري باستخدام التحليل الكروماتوغرافي السائل عالي الكفاءة ثم فحصها للتحري عن امكانياتها المضادة للسرطان عبر الارساء الجزيئي ومحاكاة الديناميكا الجزيئية ضد بروتين "آر اتش أو – أ". تم تحديد قيم الانحراف المتوسط الجذري التربيعي وقيم تقلب الجذر المتوسط المربع لكل مركب مختار، تبعها تحليل خصائص الامتصاص والتوزيع والتمثيل الغذائي والإفراز والسمية.

النتائج

وجدت المركبات متعددة الفينول حمض الغاليك وحمض الساليسيليك وحمض الكافيك والكيمفيرول والروتين والكيرستين والكومارين وحمض الفيروليك وحمض السينابيك وحمض النبق وحمض الفانيليك وحمض الكلوروجينيك في المستخلص الميثانولي للعليق البحري. بناء على قاعدة ليبنسكي الخماسية ودرجة فينا وحجم التجويف، تم اختيار خمسة روابط لمزيد من البحث حيث تظهر خصائص ملحوظة. وفقا لذلك، تبين حمض الكافيك كمركب بارز مع خصائص امتصاص وتوزيع وتمثيل غذائي وطرح وسمية جذابة ودرجة ارساء ونتائج محاكاة ديناميكية جزيئية مثالية.

الاستنتاجات

نظرا لبقائه سليما وارتباطه ببنية البروتين طوال فترة المحاكاة، مما يدل على تفاعل قوي بين البروتين والرابط ويشير لتاثير تثبيطي محتمل، قد يمتلك حمض الكافيك القدرة العظمى على تثبيط بروتين "آر اتش أو – أ". وبالتالي، مطلوب مزيد من البحث لدراسة حمض الكافيك كخيار دوائي محتمل للتطوير الدوائي المستقبلي.

查看原文本刊更多论文

针对RhoA蛋白的沙棘多酚作为潜在肝癌治疗药物的计算机筛选

研究目标，因为扰动rhch或gtbes蛋白质信号与多种癌症有关，可以将其作为治疗肝癌的潜在目标。在喀拉拉邦山区，一种重要的药用植物叫海葵。据认为，该物质含有可抑制rhh - a蛋白的多苯酚化合物，可产生肝癌的效果。利用高活性液体色谱分析法，在海洋浮游生物的甲烷酯提取物中发现多苯酚化合物，然后对其进行检测，以研究其在分子沉积床上的抗癌潜力，并模拟抗rhh - a蛋白的分子动力学。确定了每一特定化合物的平方方根偏差和正方根波动值，然后分析了吸收、分布、代谢、排泄和毒性特性。多氯联苯、盐酸、盐酸、全氟辛酸、甘醇、蛋白质、霉素、康乃林、叶酸、辛酸酸、芬兰酸、盐酸、盐酸、盐酸。根据利宾斯基的五大基座、维也纳的大小和洞的大小，选择了五个链接，供进一步研究，因为其中显示出显著特征。因此，全氟辛酸是一种独特的化合物，具有吸收、分配、食物代表性、诱惑力、沉淀程度和优美的分子动力学模拟结果。这些结论认为其完好无损，并与整个模拟过程中蛋白质结构的关联，这表明蛋白质与链接之间的强大相互作用以及可能产生的抑制效应，因此，足够酸可能具有抑制rhh - a蛋白的超能力。因此，需要开展进一步研究，以研究作为作为未来药物开发的一种潜在药物选择。

本文章由计算机程序翻译，如有差异，请以英文原文为准。

求助全文

约1分钟内获得全文求助全文

来源期刊