美国黑人患慢性肾脏病的单祖先与多祖先多基因风险评分。

背景：慢性肾脏病（CKD）是心血管疾病和早期死亡的风险因素。最近，多基因风险评分（PRS）被用来量化慢性肾脏病的风险。然而，非洲血统人群在 CKD 遗传研究和 PRS 整体开发中的代表性不足。此外，欧洲血统的 PRS 在非洲血统人群中的预测性能也有所下降：本研究旨在为美国黑人制定 CKD PRS。我们从 "百万退伍军人计划"（MVP）和 "中风的地理和种族差异原因"（REGARDS）研究中的估计肾小球滤过率（eGFR）全基因组关联研究（GWAS）的荟萃分析中获得了评分权重，从而开发出了eGFR PRS。我们在高血压遗传流行病学网络 (HyperGEN) 的参与者队列中优化了 PRS 风险模型。我们还在精准医学跨奥美病学联盟（TOPMed）和高血压相关治疗遗传学研究（GenHAT）的黑人参与者子集中进行了验证：定义为 3 期或 3 期以上的 CKD 患病率与 PRS 呈连续预测关系（OR[95% CI]:1.35[1.08,1.68]），且呈阈值依赖关系。此外，将 APOL1 风险状态（一种在撒哈拉以南非洲后裔中发病率较高的 CKD 潜在变异体）包括在内可提高评分的准确性。PRS 与传统的 CKD 风险因素以及基于先前的 eGFR 方程的 CKD 分类的敏感性分析结果一致。与之前发表的 PRS 相比，我们的 PRS 预测性能与欧洲血统的肾脏特征 PRS 不相上下。然而，这两种单一宗族的 PRS 预测性均低于多宗族衍生的 PRS：在这项研究中，我们开发了一种与慢性肾脏病有显著相关性的 PRS，当包括 APOL1 风险状况时，其预测准确性有所提高。然而，在我们的研究中，从多祖先群体中得出的 PRS 优于单祖先 PRS。