POLYMORPHISM OF αS1-CASEIN GENE IN DAIRY GOATS OF DIFFERENT BREEDS

Abstract

В статье приводятся результаты исследования полиморфизма в гене CSN1S1 у разных пород молочных коз. Идентификацию аллелей В1, В2, В3, В4 и С определяли методом ПЦР-РТ с использованием специфических праймеров и различных режимов амплификации. Популяционно-генетические параметры включали частоту встречаемости аллелей и генотипов по ним, тест гетерозиготности, критерий χ2. В нубийской породе коз с наибольшей частотой встречались аллели С и В4, в альпийской — В1, В3 и В4, у мурсиано-гранадина — В2 и В4. Из 15 возможных генотипов по выявленным аллелям у альпийских коз идентифицировано 14, у пород нубийская и мурсиано-гранадина — 13 и 12 соответственно. Наиболее часто у нубийских коз встречался гомозиготный генотип СС (0,41), который не выявлен у особей пород альпийская и мурсиано-гранадина; среди альпийских коз с наибольшей частотой встречался генотип В1В3 (0,30), который в значительно меньшей степени обнаруживался среди нубийских коз (0,09) и не выявлен у коз мурсиано-гранадина. Установлено нарушение генетического равновесия в гене CSN1S1 во всех изученных породах (χ2 от 63,62 до 89,39), при этом у альпийских коз смещение обусловлено избытком гетерозиготных аллелей, тогда как у пород нубийская и мурсиано-гранадина — их недостатком. Наибольшее число эффективных аллелей было у коз мурсиано-гранадина (4,58), наименьшее — у нубийских (3,36). Результаты генотипирования позволят провести сравнительный анализ продуктивности и качественных показателей молока у коз при разных сочетаниях интересующих нас аллелей и выявить наиболее ценные из них для применения в селекции каждой породы. The article presents the results of a study on the polymorphism of the CSN1S1 gene in different breeds of dairy goats. DNA was extracted with the ExtractDNABlood&Cells kit, and the identification of alleles B1, B2, B3, B4, and C was determined with PCR-RT on a CFX96 thermal cycler with specific primers and different amplification protocols. Allele frequency, intra- and inter-breed differences, and chi-square test were calculated with the Popgene and GenAlEx software programs. It was found that the alleles C and B4 were most frequently observed in the Nubian breed, while the Alpine breed had a high frequency of alleles B1, B3, and B4, and the Murciano-Granadina breed had a high frequency of alleles B2 and B4. Among of 15 possible genotypes according to the identified alleles, 14 were identified in Alpine goats, 13 in Nubian goats, and 12 in Murciano-Granadina goats. The homozygous genotype CC was most commonly found in Nubian goats and was not detected in Alpine or Murciano-Granadina goats. The genotype B1B3 was most frequently observed in Alpine goats (0,30), to a lesser extent in Nubian goats (0,09), and was not detected in Murciano-Granadina goats. Genetic disequilibrium was found in the CSN1S1 gene in all studied breeds (χ2from 63.62 to 89.39). In Alpine goats, the deviation was due to an excess of heterozygous genotypes, while in Nubian and Murciano-Granadina breeds, there was a deficiency of heterozygotes. The highest number of effective alleles was found in Murciano-Granadina goats (4.58), and the lowest in Nubian goats (3.36). The genotyping results will allow to conduct a comparative analysis of milk productivity and quality indicators among goats with different genotypes, and will help identify the most valuable traits for selection in each breed.