Bilecik İli İris Yetiştirilen Alanlarda Potyvirus Enfeksiyonlarının Durumu ve Moleküler Karakterizasyonu

Türkiye Tarımsal Araştırmalar Dergisi Pub Date : 2024-03-08 DOI:10.19159/tutad.1342858

Merve Koç, Filiz RANDA ZELYÜT

{"title":"Bilecik İli İris Yetiştirilen Alanlarda Potyvirus Enfeksiyonlarının Durumu ve Moleküler Karakterizasyonu","authors":"Merve Koç, Filiz RANDA ZELYÜT","doi":"10.19159/tutad.1342858","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Dünyada yapılan çalışmalarda iris (Iris spp.) bitkilerinde birçok viral etmenin yoğun enfeksiyonlara neden olduğunu göstermiştir. Bunlardan potyvirüs cinsi türlerinin yaygın olduğu ve bitkilere önemli ölçüde zarar verdiği kaydedilmiştir. Türkiye’de ise hemen hemen her yerde yetişen iris bitkisinde potyviruslerin neden olduğu enfeksiyonlara yönelik çalışmalar oldukça sınırlıdır. Bu çalışma kapsamında 2022 yılında 34 simptomatik ve 7 asimptomatik olmak üzere toplam 41 iris bitkisi Güney Marmara bölgesinde bulunan Bilecik ilinden toplanmıştır. Örnekler potyvirus cinsine özgün dejenere primeler kullanarak konvansiyonel moleküler (RT-PCR) yöntemlerle testlenmiştir. Şiddetli mozaik belirtiler gösteren 6 bitkide potyvirus enfeksiyonu tespit edilmiştir. Elde edilen 6 potyvirus fragmentinin nükleotit dizileme çalışmaları tamamlandıktan sonra enfeksiyonlar İris şiddetli mozaik virüsü (Iris severe mosaic virus, ISMV)’nün neden olduğu belirlenmiştir. Bu izolatlar kendi aralarında yüksek %94’ün üzerinde nükleotit benzerliği gösterirken global izolat ile %82-99 oranlarında benzerlik göstermiştir. Filogenetik analizler ise bu dejenere primerle elde edilen NIb gen bölgesine göre potyvirüs türlerinin kendi aralarında başarılı bir şekilde ayrıldığını göstermiştir.","PeriodicalId":515907,"journal":{"name":"Türkiye Tarımsal Araştırmalar Dergisi","volume":"33 13","pages":""},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2024-03-08","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Türkiye Tarımsal Araştırmalar Dergisi","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.19159/tutad.1342858","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}

引用次数: 0

Abstract

Dünyada yapılan çalışmalarda iris (Iris spp.) bitkilerinde birçok viral etmenin yoğun enfeksiyonlara neden olduğunu göstermiştir. Bunlardan potyvirüs cinsi türlerinin yaygın olduğu ve bitkilere önemli ölçüde zarar verdiği kaydedilmiştir. Türkiye’de ise hemen hemen her yerde yetişen iris bitkisinde potyviruslerin neden olduğu enfeksiyonlara yönelik çalışmalar oldukça sınırlıdır. Bu çalışma kapsamında 2022 yılında 34 simptomatik ve 7 asimptomatik olmak üzere toplam 41 iris bitkisi Güney Marmara bölgesinde bulunan Bilecik ilinden toplanmıştır. Örnekler potyvirus cinsine özgün dejenere primeler kullanarak konvansiyonel moleküler (RT-PCR) yöntemlerle testlenmiştir. Şiddetli mozaik belirtiler gösteren 6 bitkide potyvirus enfeksiyonu tespit edilmiştir. Elde edilen 6 potyvirus fragmentinin nükleotit dizileme çalışmaları tamamlandıktan sonra enfeksiyonlar İris şiddetli mozaik virüsü (Iris severe mosaic virus, ISMV)’nün neden olduğu belirlenmiştir. Bu izolatlar kendi aralarında yüksek %94’ün üzerinde nükleotit benzerliği gösterirken global izolat ile %82-99 oranlarında benzerlik göstermiştir. Filogenetik analizler ise bu dejenere primerle elde edilen NIb gen bölgesine göre potyvirüs türlerinin kendi aralarında başarılı bir şekilde ayrıldığını göstermiştir.

查看原文本刊更多论文

比勒奇克省鸢尾种植区罂粟病毒感染的现状和分子特征

世界范围内进行的研究表明，许多病毒病原体会对鸢尾（鸢尾属）植物造成严重感染。其中，壶状病毒种类广泛，会对植物造成严重危害。土耳其的鸢尾植物几乎随处可见，但有关鸢尾病毒感染的研究却非常有限。本研究于 2022 年在南马尔马拉地区的比勒奇克省共采集了 41 株鸢尾，其中 34 株有症状，7 株无症状。样本采用传统的分子（RT-PCR）方法进行检测，使用的是堇菜病毒属的特异性退化引物。在 6 株出现严重马赛克症状的植物中检测到了壶状病毒感染。对获得的 6 个壶状病毒片段进行核苷酸测序后，确定这些感染是由鸢尾严重花叶病毒（ISMV）引起的。这些分离株之间的核苷酸相似度高达 94%以上，与全球分离株的相似度为 82-99%。系统进化分析表明，根据使用这种退化引物获得的 NIb 基因区，成功地分离出了钵形病毒的不同种类。

本文章由计算机程序翻译，如有差异，请以英文原文为准。

求助全文

约1分钟内获得全文求助全文

来源期刊

Türkiye Tarımsal Araştırmalar Dergisi

自引率

0.00%

发文量