ПОЛНОГЕНОМНЫЙ АНАЛИЗ АССОЦИАЦИЙ С ЖИРНОКИСЛОТНЫМ СОСТАВОМ МОЛОКА КОРОВ КРАСНОЙ ГОРБАТОВСКОЙ ПОРОДЫ

Е.Н. Нарышкина, А. А. Сермягин, И.С. Недашковский, И А Лашнева, Мария Егоровна Михайлова, Д.В. Тодуа, Н. А. Зиновьева
{"title":"ПОЛНОГЕНОМНЫЙ АНАЛИЗ АССОЦИАЦИЙ С ЖИРНОКИСЛОТНЫМ СОСТАВОМ МОЛОКА КОРОВ КРАСНОЙ ГОРБАТОВСКОЙ ПОРОДЫ","authors":"Е.Н. Нарышкина, А. А. Сермягин, И.С. Недашковский, И А Лашнева, Мария Егоровна Михайлова, Д.В. Тодуа, Н. А. Зиновьева","doi":"10.33943/mms.2023.44.94.001","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Исследован спектр жирных кислот (ЖК) молока (245 образцов) коров генофондной красной горбатовской породы. В структуре компонентов жирнокислотного состава молока преобладали насыщенные ЖК — до 62% (С16:0 — 0,794 г/100 г молока). В группе мононенасыщенных ЖК обнаружено высокое содержание олеиновой (С18:1) ЖК — 1,126 г/100 г молока. В зависимости от длины углеродной цепи в весенне-летний период в молоке коров преобладают средне- и длинноцепочечные ЖК — 1,165 и 1,433 г/100 г молока соответственно. Доля трансизомеров жирных кислот в молоке составила почти 2% (Сv — 90%). Между собой жирные кислоты, независимо от насыщенности и длины цепи, имеют положительную корреляцию более 0,7. Выявлены общие кластеры на BTA 9 и 22 — для пальмитиновой и миристиновой ЖК; на BTA 20 — для пальмитиновой, миристиновой и олеиновой ЖК; на BTA 25 — для пальмитиновой, миристиновой, стеариновой и олеиновой ЖК. Обнаружены общие ассоциации, не зависящие от длины цепи жирных кислот и локализованные на хромосоме BTA 25. Группа насыщенных, ненасыщенных ЖК и трансизомеров показывает общие QTL на BTA 8 (кроме НЖК, ПНЖК), 18 (кроме МНЖК), 20 (кроме ПНЖК) и 25. Для показателей миристиновой ЖК установлены гены, образующие QTL на хромосомах BTA 1, 3, 17, 22, 25, 29: ERG, LRRC8D, RAPGEF2, TEX264, AUTS2, LIMK1, STT3A, ACRV1; для короткоцепочечных ЖК — на хромосомах BTA 1, 13: PCOLCE2, ATRN; для среднецепочечных ЖК — на BTA 25: HS3ST2; для трансизомеров — на хромосомах BTA 11, 20, 24: POLE4, C1QTNF3, CTNND2, DSG2. Следует обратить внимание на то, что для всех типов жирных кислот и трансизомеров определен участок QTL на хромосоме BTA 25 — LIMK1 и AUTS2. Данные гены оказывают плейотропное действие на целый ряд показателей жирных кислот и представляют научный интерес для дальнейшего изучения. Аннотация генов показала сопряженность их с признаками молочного белка (LRRC8D), удоя и скорости доения (LRRC8D, CTNND2), с пигментацией области глаз (ATRN), количеством соматических клеток в молоке (C1QTNF3), восприимчивостью к туберкулезу, содержанием пентадециловой кислоты в молоке и уровнем тироксина (CTNND2), а также с количеством кальция в молоке (HS3ST2).","PeriodicalId":301520,"journal":{"name":"Molochnoe i miasnoe skotovodstvo","volume":"108 5","pages":""},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2023-12-04","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Molochnoe i miasnoe skotovodstvo","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.33943/mms.2023.44.94.001","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
引用次数: 0

Abstract

Исследован спектр жирных кислот (ЖК) молока (245 образцов) коров генофондной красной горбатовской породы. В структуре компонентов жирнокислотного состава молока преобладали насыщенные ЖК — до 62% (С16:0 — 0,794 г/100 г молока). В группе мононенасыщенных ЖК обнаружено высокое содержание олеиновой (С18:1) ЖК — 1,126 г/100 г молока. В зависимости от длины углеродной цепи в весенне-летний период в молоке коров преобладают средне- и длинноцепочечные ЖК — 1,165 и 1,433 г/100 г молока соответственно. Доля трансизомеров жирных кислот в молоке составила почти 2% (Сv — 90%). Между собой жирные кислоты, независимо от насыщенности и длины цепи, имеют положительную корреляцию более 0,7. Выявлены общие кластеры на BTA 9 и 22 — для пальмитиновой и миристиновой ЖК; на BTA 20 — для пальмитиновой, миристиновой и олеиновой ЖК; на BTA 25 — для пальмитиновой, миристиновой, стеариновой и олеиновой ЖК. Обнаружены общие ассоциации, не зависящие от длины цепи жирных кислот и локализованные на хромосоме BTA 25. Группа насыщенных, ненасыщенных ЖК и трансизомеров показывает общие QTL на BTA 8 (кроме НЖК, ПНЖК), 18 (кроме МНЖК), 20 (кроме ПНЖК) и 25. Для показателей миристиновой ЖК установлены гены, образующие QTL на хромосомах BTA 1, 3, 17, 22, 25, 29: ERG, LRRC8D, RAPGEF2, TEX264, AUTS2, LIMK1, STT3A, ACRV1; для короткоцепочечных ЖК — на хромосомах BTA 1, 13: PCOLCE2, ATRN; для среднецепочечных ЖК — на BTA 25: HS3ST2; для трансизомеров — на хромосомах BTA 11, 20, 24: POLE4, C1QTNF3, CTNND2, DSG2. Следует обратить внимание на то, что для всех типов жирных кислот и трансизомеров определен участок QTL на хромосоме BTA 25 — LIMK1 и AUTS2. Данные гены оказывают плейотропное действие на целый ряд показателей жирных кислот и представляют научный интерес для дальнейшего изучения. Аннотация генов показала сопряженность их с признаками молочного белка (LRRC8D), удоя и скорости доения (LRRC8D, CTNND2), с пигментацией области глаз (ATRN), количеством соматических клеток в молоке (C1QTNF3), восприимчивостью к туберкулезу, содержанием пентадециловой кислоты в молоке и уровнем тироксина (CTNND2), а также с количеством кальция в молоке (HS3ST2).
全基因组分析与红色戈尔巴托夫奶牛牛奶脂肪酸组成的关系
对基因丰红戈尔巴托夫品种奶牛的牛奶(245 个样本)脂肪酸(FA)谱进行了研究。在牛奶脂肪酸成分结构中,饱和低聚物占主导地位 - 高达 62% (C16:0 - 0.794 克/100 克牛奶)。在单不饱和低聚物组中,油酸(C18:1)低聚物含量较高 - 1.126 克/100 克牛奶。根据碳链长度的不同,中链和长链低聚物在春夏季奶牛的牛奶中占主导地位--分别为 1.165 克/100 克牛奶和 1.433 克/100 克牛奶。牛奶中脂肪酸反式异构体的比例接近 2%(Cv - 90%)。无论饱和度和链长如何,脂肪酸之间的正相关性都大于 0.7。在 BTA 值为 9 和 22 时,发现棕榈酸和肉豆蔻酸低聚物的共同聚类;在 BTA 值为 20 时,发现棕榈酸、肉豆蔻酸和油酸低聚物的共同聚类;在 BTA 值为 25 时,发现棕榈酸、肉豆蔻酸、硬脂酸和油酸低聚物的共同聚类。研究发现,共同的关联与脂肪酸链长度无关,并定位在 BTA 25 染色体上。一组饱和、不饱和低聚物和反式异构体在 BTA 8(PUFA、PUFA 除外)、18(MSFA 除外)、20(PUFA 除外)和 25 上显示出共同的 QTLs。在肉豆蔻低聚糖指标方面,在 BTA 1、3、17、22、25、29 号染色体上形成 QTL 的基因已被确定:ERG、LRRC8D、RAPGEF2、TEX264、AUTS2、LIMK1、STT3A、ACRV1;在短链低聚糖方面,在 BTA 1、13 号染色体上:PCOLCE2、ATRN;BTA 25 上的中链低聚物:HS3ST2;BTA 11、20、24 染色体上的反式异构体:POLE4、C1QTNF3、CTNND2、DSG2。值得注意的是,对于所有类型的脂肪酸和反式异构体,在 BTA 25 号染色体上都发现了一个 QTL 位点--LIMK1 和 AUTS2。这些基因对一系列脂肪酸指数具有多效应,值得进一步研究。对这些基因的注释表明,它们与乳蛋白(LRRC8D)、产奶量和挤奶率(LRRC8D、CTNND2)、眼部色素沉着(ATRN)、乳中体细胞数(C1QTNF3)、结核病易感性、乳中十五烷酸含量和甲状腺素水平(CTNND2)以及乳中钙(HS3ST2)有关。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
求助全文
约1分钟内获得全文 求助全文
来源期刊
自引率
0.00%
发文量
0
×
引用
GB/T 7714-2015
复制
MLA
复制
APA
复制
导出至
BibTeX EndNote RefMan NoteFirst NoteExpress
×
提示
您的信息不完整,为了账户安全,请先补充。
现在去补充
×
提示
您因"违规操作"
具体请查看互助需知
我知道了
×
提示
确定
请完成安全验证×
copy
已复制链接
快去分享给好友吧!
我知道了
右上角分享
点击右上角分享
0
联系我们:info@booksci.cn Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。 Copyright © 2023 布克学术 All rights reserved.
京ICP备2023020795号-1
ghs 京公网安备 11010802042870号
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:604180095
Book学术官方微信