COMPARAÇÃO FÍSICO-QUÍMICA E ESTRUTURAL DO PRECURSOR 11S DE GLOBULINA ENTRE HELIANTHUS ANNUUS L. E HELIANTHUS ARGOPHYLLUS TORR. & GRAY

Mark Melo Martins, Mônica Trindade Abreu
{"title":"COMPARAÇÃO FÍSICO-QUÍMICA E ESTRUTURAL DO PRECURSOR 11S DE GLOBULINA ENTRE HELIANTHUS ANNUUS L. E HELIANTHUS ARGOPHYLLUS TORR. & GRAY","authors":"Mark Melo Martins, Mônica Trindade Abreu","doi":"10.51189/rema/2422","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Introdução: O girassol é uma planta cultivada no mundo todo e possui grande interesse comercial por suas características estéticas e nutricionais, sendo uma das oleaginosas mais comercializadas mundialmente para fins comestíveis e de biocombustível. Objetivo: Este trabalho teve como objetivo comparar dois precursores da proteína globulina 11S – que é uma proteína importante para o armazenamento vegetal – em níveis físico-químicos e estruturais de duas espécies do gênero Helianthus com a intenção de encontrar possíveis diferenças entre estes precursores, e inferir possível influência em que leva uma espécie a ter fins do uso do seu óleo e a outra para usos ornamentais, com baixa produção de óleo. Materiais e Métodos: Para realizar esta comparação foram utilizadas as ferramentas de bioinformática BLAST no servidor do National Center for Biotechnology Information (NCBI) para comparar as sequências das proteínas das duas espécies, sendo também utilizado o programa Clustal Ômega para que fosse feita a seleção da melhor sequência de H. annuus (L.); para a comparação da estrutura das proteínas inicialmente foi feita a modelagem no Swiss-Model e comparadas as estruturas no software PyMol. Resultados: As sequências apresentaram 96% de identidade, considerando os 2% de gaps, o escore do alinhamento foi de 671 bits, ao total apresentaram a conservação de 4 domínios de grupos fortes e 1 conservação de um domínio de grupos fracos, além das conservações completas do resto da sequência. Com isso, a sobreposição estrutural demonstrou que a área típica desta família de proteínas, a do barril característico das proteínas Cupin, prevaleceu conservada. A proteína de H. annus (L.) apresentou maior peso molecular, maior PI teórico e maior quantidade de resíduos com cargas negativas, contabilizando 32 peptídeos de aspartato e glutamato responsáveis por estas cargas. As variações notadas foram mínimas nas biomoléculas, porém ainda assim possuem os principais domínios quase que completamente conservados demonstrando que a baixa variação pode ocorrer devido à proximidade evolutiva das duas espécies. Conclusão: Logo, pode-se inferir que os precursores parciais 11S da globulina não seriam os principais agentes responsáveis para que H. annuus (L.) seja preferível para extração de seu óleo em comparação com H. agrophyllus Torr. & Gray.","PeriodicalId":138762,"journal":{"name":"Anais do I Congresso Brasileiro de Biotecnologia Vegetal On-line","volume":"14 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2021-11-22","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Anais do I Congresso Brasileiro de Biotecnologia Vegetal On-line","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.51189/rema/2422","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
引用次数: 0

Abstract

Introdução: O girassol é uma planta cultivada no mundo todo e possui grande interesse comercial por suas características estéticas e nutricionais, sendo uma das oleaginosas mais comercializadas mundialmente para fins comestíveis e de biocombustível. Objetivo: Este trabalho teve como objetivo comparar dois precursores da proteína globulina 11S – que é uma proteína importante para o armazenamento vegetal – em níveis físico-químicos e estruturais de duas espécies do gênero Helianthus com a intenção de encontrar possíveis diferenças entre estes precursores, e inferir possível influência em que leva uma espécie a ter fins do uso do seu óleo e a outra para usos ornamentais, com baixa produção de óleo. Materiais e Métodos: Para realizar esta comparação foram utilizadas as ferramentas de bioinformática BLAST no servidor do National Center for Biotechnology Information (NCBI) para comparar as sequências das proteínas das duas espécies, sendo também utilizado o programa Clustal Ômega para que fosse feita a seleção da melhor sequência de H. annuus (L.); para a comparação da estrutura das proteínas inicialmente foi feita a modelagem no Swiss-Model e comparadas as estruturas no software PyMol. Resultados: As sequências apresentaram 96% de identidade, considerando os 2% de gaps, o escore do alinhamento foi de 671 bits, ao total apresentaram a conservação de 4 domínios de grupos fortes e 1 conservação de um domínio de grupos fracos, além das conservações completas do resto da sequência. Com isso, a sobreposição estrutural demonstrou que a área típica desta família de proteínas, a do barril característico das proteínas Cupin, prevaleceu conservada. A proteína de H. annus (L.) apresentou maior peso molecular, maior PI teórico e maior quantidade de resíduos com cargas negativas, contabilizando 32 peptídeos de aspartato e glutamato responsáveis por estas cargas. As variações notadas foram mínimas nas biomoléculas, porém ainda assim possuem os principais domínios quase que completamente conservados demonstrando que a baixa variação pode ocorrer devido à proximidade evolutiva das duas espécies. Conclusão: Logo, pode-se inferir que os precursores parciais 11S da globulina não seriam os principais agentes responsáveis para que H. annuus (L.) seja preferível para extração de seu óleo em comparação com H. agrophyllus Torr. & Gray.
球蛋白前体11S的理化和结构比较。&灰色
简介:向日葵是一种世界范围内种植的植物,由于其美学和营养特性而具有巨大的商业价值,是世界上最商业化的可食用和生物燃料油籽之一。目的:这个工作的目的是比较两个前体蛋白11 s球蛋白—是一种重要的植物—存储在物理化学和结构层次的向日葵属的两种动物为了找到这些前兆之间可能存在的差异,推断可能会影响一个物种的有目的的使用油,另一个用于装饰用途,石油产量较低。材料和方法:对比来实现生物信息学工具使用爆炸在服务器的国家生物技术信息中心(NCBI)比较了两个物种的蛋白质序列,同时作为项目Clustal方程用于行使的选择最好的程序h annuus (l);为了比较蛋白质结构,首先在瑞士模型中进行建模,然后在PyMol软件中进行结构比较。结果:考虑到2%的间隙,序列同一性为96%,比对得分为671位,除序列其余部分完全保守外,还显示4个强群域守恒和1个弱群域守恒。因此,结构重叠表明,该蛋白家族的典型区域,即Cupin蛋白的典型桶状区域,是保守的。H. annus (L.)蛋白具有较高的分子量、较高的理论PI和更多的带负电荷的残基,有32个天冬氨酸和谷氨酸肽负责这些电荷。在生物分子中观察到的变异是最小的,但仍然有几乎完全保守的主要域,这表明低变异可能发生由于两个物种的进化接近。结论:因此,可以推断球蛋白的部分前驱体11S不是导致黄花蓟马(L. annuus)比农业蓟马(H. agrophyllus Torr)更适合提取其油的主要因素。&灰色。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
求助全文
约1分钟内获得全文 求助全文
来源期刊
自引率
0.00%
发文量
0
×
引用
GB/T 7714-2015
复制
MLA
复制
APA
复制
导出至
BibTeX EndNote RefMan NoteFirst NoteExpress
×
提示
您的信息不完整,为了账户安全,请先补充。
现在去补充
×
提示
您因"违规操作"
具体请查看互助需知
我知道了
×
提示
确定
请完成安全验证×
copy
已复制链接
快去分享给好友吧!
我知道了
右上角分享
点击右上角分享
0
联系我们:info@booksci.cn Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。 Copyright © 2023 布克学术 All rights reserved.
京ICP备2023020795号-1
ghs 京公网安备 11010802042870号
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:481959085
Book学术官方微信