Determination of the carriage of the «chimeric» CYP21A1P/CYP21A2 gene in families with a proband with non-classical congenital adrenal hyperplasia

Abstract

Более 90% случаев врожденной дисфункции коры надпочечников (ВДКН) связаны с изменениями в гене CYP21A2, из которых около 20% приходится на различные типы «химерных» генов CYP21A1P/CYP21A2. Проблема идентификации «химерных» генов и взаимосвязи их типов с клиническими формами ВДКН актуальна до настоящего времени. Исследование посвящено анализу «химерного» гена CH4 при неклассической форме ВДКН. В работе использовали методы ПЦР-ПДРФ анализа и секвенирования по Сэнгеру. Проанализированы образцы ДНК 3-х пробандов с неклассической формой ВДКН и их родителей. ПЦР-ПДРФ анализ с CYP21A2 генспецифичными праймерами не позволил определить химерные гены у родителей пробандов, но дал возможность предположить их наличие у самих пробандов. Комплексный анализ с использованием всех методов и псевдоген- и генспецифичных праймеров показал наличие у каждого из трех пробандов химерного гена CH4 в компаунд-гетерозиготном состоянии: в первом случае - с вариантом I173N, во втором - с i2 splice и в 3-м с - 30кб делецией гена CYP21A2. Для молекулярно-генетического анализа в семьях с дефицитом 21-гидроксилазы необходимо применение как анализа точковых мажорных мутаций, так и методов, выявляющих делеционно-дупликационные события в гене CYP21A2. Наличие химерного гена CH4 с точкой разрыва между позициями chr6:38038514 и chr6:32038938 (GRCh38) в компаунде с другими патогенными вариантами приводит к неклассической форме ВДКН. 90% of cases of congenital adrenal hyperplasia (CAH) are associated with changes in the CYP21A2 gene, of which about 20% are in various “chimeric” CYP21A1P/CYP21A2 genes. The problem of identifying “chimeric” genes and the relationship of their various types with the CAH clinical forms is still relevant today. The study is devoted to the analysis of the “chimeric” CH4 gene in the non-classical form of CAH. We used the methods of PCR-RFLP analysis and Sanger sequencing. DNA samples of 3 probands with a non-classical form of CAH and their parents were analyzed. The use of PCR-RFLP analysis with CYP21A2 gene-specific primers did not allow us to identify “chimeric” genes in the parents of the probands, but made it possible to assume their presence in the probands themselves. Whereas a complex analysis using all methods and pseudogene and gene-specific primers showed the presence in each of the 3 probands of the “chimeric” CH4 gene in the compound heterozygous state. In the first case, with the I173N variant, in the second, with i2 splice, and in the 3rd, with the 30 kb deletion of the CYP21A2 gene. For molecular genetic analysis in families with 21-hydroxylase deficiency, it is necessary to use both the analysis of major point mutations and methods that detect deletion-duplication events in the CYP21A2 gene. The presence of a “chimeric” CH4 gene with a break point between positions chr6:38038514 and chr6:32038938 (GRCh38) in a compound with other pathogenic variants leads to the nonclassical form of CAH.