IL-17F gene polymorphisms in cystic fibrosis patients: influence on mortality rate

Пухальская, Д.А., Шмарин, В.В., Семыкин, С.Ю., Красовский, С.А., Букина, Т.М., Шмарина, Г.В.
{"title":"IL-17F gene polymorphisms in cystic fibrosis patients: influence on mortality rate","authors":"Пухальская, Д.А., Шмарин, В.В., Семыкин, С.Ю., Красовский, С.А., Букина, Т.М., Шмарина, Г.В.","doi":"10.25557/2073-7998.2022.10.33-37","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Цель работы состояла в исследовании влияния аллельных полиморфизмов гена IL-17F rs2397084 (Glu126Gly) и rs763780 (His161Arg) на выживаемость пациентов с муковисцидозом. В исследовании принимали участие 82 пациента. Все участники исследования находились на активном диспансерном наблюдении, регулярно (каждые 3-6 месяцев) обследовались и получали антибактериальную терапию. Частоты аллелей A и G полиморфизма rs2397084 в группе обследованных пациентов составили 90,2 % и 9,8 % соответственно. Частоты аллелей A и G полиморфизма rs763780 были равны 92,1 % и 7,9 %. В зависимости от генотипа пациенты были разделены на 2 группы. Группа 1 состояла из пациентов с распространенным генотипом AA-AA (rs2397084-rs763780; n=55). Группа 2 включала носителей одного или нескольких аллелей G (n=27). Анализ демографических данных показал, что группы пациентов не различались по возрасту, полу, а также по количеству носителей мутации F508del. За период с 2015 по 2020 гг. в группе 1 умерли 14 пациентов, в группе 2 все пациенты остались живы. Таким образом, выживаемость в группах 1 и 2 составила, соответственно, 74,5 и 100 % (p=0,0035, точный критерий Фишера). Анализ кривых Каплана-Майера показал, что общая выживаемость пациентов первой группы была статистически значимо ниже, чем соответствующий параметр в группе 2 (р=0,0026, Log-Rank Test). Анализ состава микробиома дыхательных путей выявил в группе 1 существенное преобладание пациентов с хронической колонизацией Burkholderia cepacia complex: 22 vs 1 пациент в группе 2 (χ2 = 11,82, p = 0,0006; OR 17,33 [95% CI 2,19-137,21]). Таким образом, повышенная смертность больных муковисцидозом с распространенным генотипом AA-AA связана с высокой частотой развития хронической инфекции Burkholderia cepacia complex. Для получения достоверных данных о рисках заражения Burkholderia cepacia complex и неблагоприятном исходе заболевания необходимо увеличить количество обследованных пациентов.\n The aim of this study was to evaluate effects of IL-17F gene polymorphisms, rs2397084 (substitution of glutamic acid (GAG) for glycine (GGG) at position 126; Glu126Gly) and rs763780 (substitution of histidine (CAT) for arginine (CGT) at position 161; His161Arg) on the cystic fibrosis (CF) patients mortality rate. The study involved 82 patients who were regularly examined (every 3-6 months) and received antibiotic therapy. The frequency of IL-17F (rs2397084) A and G alleles was 90.2% and 9.8%, respectively. The frequency of IL-17F (rs763780) A and G alleles was 92.1% and 7.9%, respectively. The patients were divided into two groups. Group 1 included individuals with common AA-AA genotype (n=55). Group 2 included carriers of one or more minor G alleles (n=27). The patients of two groups did not differ in age, sex, or number of F508del mutation carriers. At the same time, there were 14 dead patients in group 1, whereas all patients from group 2 were alive. Thus, survival in groups 1 and 2 was 74.5% and 100%, respectively (p=0.0035, Fisher’s exact test). Analysis of the Kaplan-Meier curves showed that the overall survival of patients in the group 1 was significantly lower than the corresponding parameter in the group 2 (p=0.0026, Log-Rank Test). Repeated microbiological studies of sputum samples revealed a significant predominance of patients with chronic colonization of the Burkholderia cepacia complex (Bcc) in this group: 22 vs 1 patient in group 2 (χ2 = 11.82, p = 0.0006; OR 17.33 [95% CI 2.19-137.21]). Thus, increased mortality rate in CF patients with common AA-AA genotype is associated with a high incidence of chronic Bcc infection. Further investigations with increased number of participants are needed to estimate more accurately the true risks of Bcc infection and poor outcomes in CF patients with different IL-17F gene polymorphisms.","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"59 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0000,"publicationDate":"2022-10-31","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"0","resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","FirstCategoryId":"1085","ListUrlMain":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.10.33-37","RegionNum":0,"RegionCategory":null,"ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"","JCRName":"","Score":null,"Total":0}
引用次数: 0

Abstract

Цель работы состояла в исследовании влияния аллельных полиморфизмов гена IL-17F rs2397084 (Glu126Gly) и rs763780 (His161Arg) на выживаемость пациентов с муковисцидозом. В исследовании принимали участие 82 пациента. Все участники исследования находились на активном диспансерном наблюдении, регулярно (каждые 3-6 месяцев) обследовались и получали антибактериальную терапию. Частоты аллелей A и G полиморфизма rs2397084 в группе обследованных пациентов составили 90,2 % и 9,8 % соответственно. Частоты аллелей A и G полиморфизма rs763780 были равны 92,1 % и 7,9 %. В зависимости от генотипа пациенты были разделены на 2 группы. Группа 1 состояла из пациентов с распространенным генотипом AA-AA (rs2397084-rs763780; n=55). Группа 2 включала носителей одного или нескольких аллелей G (n=27). Анализ демографических данных показал, что группы пациентов не различались по возрасту, полу, а также по количеству носителей мутации F508del. За период с 2015 по 2020 гг. в группе 1 умерли 14 пациентов, в группе 2 все пациенты остались живы. Таким образом, выживаемость в группах 1 и 2 составила, соответственно, 74,5 и 100 % (p=0,0035, точный критерий Фишера). Анализ кривых Каплана-Майера показал, что общая выживаемость пациентов первой группы была статистически значимо ниже, чем соответствующий параметр в группе 2 (р=0,0026, Log-Rank Test). Анализ состава микробиома дыхательных путей выявил в группе 1 существенное преобладание пациентов с хронической колонизацией Burkholderia cepacia complex: 22 vs 1 пациент в группе 2 (χ2 = 11,82, p = 0,0006; OR 17,33 [95% CI 2,19-137,21]). Таким образом, повышенная смертность больных муковисцидозом с распространенным генотипом AA-AA связана с высокой частотой развития хронической инфекции Burkholderia cepacia complex. Для получения достоверных данных о рисках заражения Burkholderia cepacia complex и неблагоприятном исходе заболевания необходимо увеличить количество обследованных пациентов. The aim of this study was to evaluate effects of IL-17F gene polymorphisms, rs2397084 (substitution of glutamic acid (GAG) for glycine (GGG) at position 126; Glu126Gly) and rs763780 (substitution of histidine (CAT) for arginine (CGT) at position 161; His161Arg) on the cystic fibrosis (CF) patients mortality rate. The study involved 82 patients who were regularly examined (every 3-6 months) and received antibiotic therapy. The frequency of IL-17F (rs2397084) A and G alleles was 90.2% and 9.8%, respectively. The frequency of IL-17F (rs763780) A and G alleles was 92.1% and 7.9%, respectively. The patients were divided into two groups. Group 1 included individuals with common AA-AA genotype (n=55). Group 2 included carriers of one or more minor G alleles (n=27). The patients of two groups did not differ in age, sex, or number of F508del mutation carriers. At the same time, there were 14 dead patients in group 1, whereas all patients from group 2 were alive. Thus, survival in groups 1 and 2 was 74.5% and 100%, respectively (p=0.0035, Fisher’s exact test). Analysis of the Kaplan-Meier curves showed that the overall survival of patients in the group 1 was significantly lower than the corresponding parameter in the group 2 (p=0.0026, Log-Rank Test). Repeated microbiological studies of sputum samples revealed a significant predominance of patients with chronic colonization of the Burkholderia cepacia complex (Bcc) in this group: 22 vs 1 patient in group 2 (χ2 = 11.82, p = 0.0006; OR 17.33 [95% CI 2.19-137.21]). Thus, increased mortality rate in CF patients with common AA-AA genotype is associated with a high incidence of chronic Bcc infection. Further investigations with increased number of participants are needed to estimate more accurately the true risks of Bcc infection and poor outcomes in CF patients with different IL-17F gene polymorphisms.
囊性纤维化患者IL-17F基因多态性对死亡率的影响
研究IL-17F rs2397084 (Glu126Gly)和His161Arg (His161Arg)对囊性纤维化患者的生存影响。82名病人参与了这项研究。所有研究人员都在积极的药房监督下,定期(每3-6个月)接受检查和接受抗菌治疗。A和G同位素rs2397084的频率分别为90.2%和9.8%。A和G同位素rs763780的频率为92.1%和7.9%。根据基因组类型,患者分为两组。一组由a -AA基因广泛的病人组成(rs2397084- rs76780);n = 55)。第二组包括一个或多个G (n=27)等位基因的载体。人口统计分析显示,患者的年龄、性别和变异载体数量均为F508del。从2015年到2020年,1组1人死亡,2组2人全部存活。因此,1组和2组的存活率分别为74.5和100% (p= 0.0035,菲舍尔的准确标准)。对卡普兰-迈耶曲线的分析表明,第一组病人的整体存活率在统计学上比第2组(p = 0.0026, Log-Rank测试)低。对呼吸通路微生物成分的分析显示,1组患者中有大量长期殖民的Burkholderia cepacia complex: 2组中的22个vs 1患者(见2 = 11.82,p = 0.0006;或17.33(95%的CI 2.19 - 137.21)。因此,囊性纤维化患者的死亡率升高,其基因为AA-AA,与慢性感染Burkholderia cepacia complex的高发病率有关。为了获得可靠的数据,Burkholderia cepacia complex感染的风险和不利的结果需要增加患者的数量。这个工作室的aim是IL-17F基因polymorphisms, rs2397084 (glutamic acid)Glu126Gly和rs763780(猫)为arginine (CGT)为161;His161Arg在cystic fibrosis (CF)上。82名美国公民,他们的反应是反生物恐怖。IL-17F (rs2397084)和G alleles是90.2%和9.8%的反应。IL-17F (rs763780)和G alleles的反应是92.1%和7.9%。有两层楼高的人。集团1 includ individuals与社区AA-AA genotype (n=55)。组2是一个或更多的小G (n=27)。两种不同的发病率,性,或F508del变换的数字。在萨姆时代,有14个死去的爱国者在1组,所有的从2组活着。Thus, groups 1和2的存活率是74.5%和100%,反应性(p=0.0035, Fisher的测试)。卡普兰-梅耶斯在小组1中展示了她在第2组中幸存下来的能力,这是她在第2组(p=0.0026, Log-Rank测试)中表现出色的表现。在这个组中有22个vs 1个p1 (2), p = 0.0006;或者17.33(95%的CI 2.19-137.21)。Thus,在CF社区AA-AA基因中,与编年史Bcc infection相结合。Further引入了不受限制的部分,需要更多的Bcc信息和更多的polymorphisms的真实身份。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
求助全文
约1分钟内获得全文 求助全文
来源期刊
自引率
0.00%
发文量
0
×
引用
GB/T 7714-2015
复制
MLA
复制
APA
复制
导出至
BibTeX EndNote RefMan NoteFirst NoteExpress
×
提示
您的信息不完整,为了账户安全,请先补充。
现在去补充
×
提示
您因"违规操作"
具体请查看互助需知
我知道了
×
提示
确定
请完成安全验证×
copy
已复制链接
快去分享给好友吧!
我知道了
右上角分享
点击右上角分享
0
联系我们:info@booksci.cn Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。 Copyright © 2023 布克学术 All rights reserved.
京ICP备2023020795号-1
ghs 京公网安备 11010802042870号
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:481959085
Book学术官方微信