Detección del SARS-CoV-2 en radiografías de tórax por medio de descriptores intermedios y técnicas de machine learning

Gonzalo Bardález-Trigoso, Jean Pablo Bazán-Arzapalo, Junior Fabián, Pedro Montenegro-Montori
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Abstract

El SARS-CoV-2, que causa la enfermedad del COVID-19, es un virus que se ha expandido rápidamente por el mundo, teniendo como lugar de inicio la ciudad de Wuhan, en China. A la fecha se han detectado más de 36 738 525 casos a nivel mundial. La tasa de infectados aumenta diariamente y la capacidad sanitaria no se da abasto. Por estas razones, se ha venido proponiendo una variedad de métodos para identificar el novel coronavirus con mayor rapidez y a menor costo. Un ejemplo de estos métodos para identificar la enfermedad es el COVID-Net, una red convolucional que identifica el COVID-19, neumonía o pulmones en condición normal. En este trabajo se propone una metodología para identificar y clasifi car imágenes de radiografías de tórax que tienen el COVID-19, neumonía o sin condición. Para esto se utilizaron extractores de características intermedias: HOG+PCA, SIFT+K-means y SURF+K-means, combinados con un SVM como clasificador; además, se emplearon tres estructuras CNN: VGG19, Densenet121 y MobilnetV2. Se utilizó la base de datos COVIDx3 que consta de 15 476 imágenes radiográficas de pulmón. Se obtuvieron buenos resultados, y se determinó que la mejor de las combinaciones fue la que utilizó MobilnetV2 con aumento de datos obteniendo una sensitividad por clase COVID-19 de 0,97 y en promedio una precisión y sensitividad de 0,92 y 0,91. Debido al contexto de la crisis sanitaria generada por el COVID-19, este trabajo se presenta como un apoyo para la detección de esta enfermedad y como marco de referencia para futuras investigaciones.
用中间描述符和机器学习技术检测胸片中的SARS-CoV-2
引起COVID-19的SARS-CoV-2是一种在世界各地迅速传播的病毒,其发源地是中国武汉。迄今为止,全球已发现超过36 738 525例病例。感染率每天都在上升,卫生能力也不足。由于这些原因,人们提出了多种方法来更快、更便宜地识别新型冠状病毒。这些识别疾病方法的一个例子是COVID-19 - net,这是一个卷积网络,可以识别正常情况下的COVID-19、肺炎或肺部。这项工作提出了一种方法来识别和分类有COVID-19、肺炎或无疾病的胸片图像。为此,我们使用了中间特征提取器:HOG+PCA, SIFT+K-means和SURF+K-means,并结合SVM作为分类器;此外,还使用了三种CNN结构:VGG19、Densenet121和MobilnetV2。我们使用了COVIDx3数据库,该数据库包含15 476张肺x线照片。获得了良好的结果,并确定最佳的组合是使用MobilnetV2增加数据的组合,每个COVID-19类的敏感性为0.97,平均精度和敏感性为0.92和0.91。由于COVID-19造成的健康危机的背景,这项工作是对该疾病检测的支持,并作为未来研究的参考框架。
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