文献解读 | 中国农业科学院作物科学研究所构建基于深度学习的水稻全基因组选择新方法

本文介绍了中国农业科学院作物科学研究所联合国内多家科研单位，构建了用于水稻基因组选择的大规模中国栽培稻群体数据集，并提出了配套的全基因组预测深度学习模型DeepCCR。该研究旨在利用基因组选择技术，通过构建育种模型实现对育种材料的表型预测，从而大幅度缩短育种周期并减少育种投入。研究团队通过对4015份水稻品种（系）进行产量相关性状的表型考察，形成了具有广泛遗传代表性的中国栽培稻群体数据集。基于此数据集，研究团队开发了DeepCCR模型，用于预测不同种植地点的表型值，并帮助育种家评估特定材料的最适合种植地点。此外，研究团队还建立了网络在线服务，方便育种者使用该模型进行高效的育种决策。该研究为我国水稻高效育种提供了一个有效的数据利用、分析和共享平台，得到了国家重点研发计划等项目的资助。