Nature | 5’末端结合口袋调控DICER切割位点

背景：DICER是一种保守的RNase III酶，负责将pre-miRNA和长链dsRNA加工为成熟的miRNA和siRNA，在RNA干扰通路中起核心作用。传统观点认为DICER通过5'和3'末端计数规则确定切割位点，但末端核苷酸如何影响切割精确性尚不清楚。研究目的：本研究旨在揭示DICER如何通过5'末端结合口袋调控切割位点，以及RNA内部基序与末端规则冲突时如何决定最终切割位点。结论：研究人员发现DICER中存在两个保守的5'末端结合口袋——偏好鸟苷（G）的口袋和偏好尿苷（U）的口袋，分别促进21 nt和22 nt切割位点的对齐。通过大规模平行切割实验和冷冻电镜结构解析，证实了双口袋模型。当5'末端规则与RNA内部基序冲突时，RNA会发生显著构象重排，最终由基序决定切割位点。该研究颠覆了传统认知，揭示了DICER整合末端计数与内部基序信息的分子机制，为优化shRNA设计和RNA干扰应用提供了新策略。