iMeta高引论文 | 李雪萌/刘永鑫-评述开源软件USEARCH 12

本文背景是生物信息学和微生物组研究领域长期依赖USEARCH软件进行序列分析，但其64位版本曾为商业软件，限制了部分研究者的使用。研究目的是评述USEARCH第12版的开源发布及其对领域的影响，分析其功能变化、与替代软件的比较，并探讨开源对软件开发的促进作用。结论指出，USEARCH v12开源并免费提供所有64位版本，使研究者可免费使用核心功能，同时其开源代码有望激励领域内更多优秀生物信息学工具的开发和跨学科合作，结合人工智能发展，将推动微生物组研究基础设施的进步。