iMeta | 基因组所刘永鑫组/昊为泰生物-发布微生物扩增子绝对定量方法Accu16S/AccuITS

iMeta 2026-03-06 19:00
文章摘要
背景:传统的16S rRNA基因和ITS扩增子测序仅能提供微生物群落的相对丰度信息,其组成型特性可能导致生态学解释存在偏差。研究目的:为克服这一局限,本研究开发了Accu16S/AccuITS方法,旨在通过添加已知拷贝数的合成内标DNA,实现基于标准曲线回归的微生物扩增子绝对定量。结论:该方法适用于多种样本类型,一次测序即可同时获得相对丰度、总绝对丰度及分类单元特异性绝对丰度。验证表明其准确性与qPCR和毛细管电泳法相当,且多个案例研究证明绝对定量能提供比相对丰度更具生态和功能意义的见解。尽管存在增加实验复杂性和成本等局限性,但该方法具有高通量、广泛适用性等优势,为微生物组研究提供了有力的工具。
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