Research|从病理图像预测单细胞空间转录组:PRTS 开启低成本高分辨率空间生物学新时代

Research科学研究 2026-01-23 08:47
文章摘要
背景:空间转录组学技术能揭示基因表达的空间分布,对理解发育和疾病至关重要,但现有技术成本高、操作复杂,尤其是单细胞分辨率数据稀缺。研究目的:开发一种名为PRTS的新型深度学习框架,旨在仅利用常规H&E染色病理图像来预测单细胞分辨率的空间转录组数据,以降低成本并提升分辨率。结论:PRTS模型成功预测了小鼠大脑、人类肺癌和乳腺癌组织中基因表达的空间模式,实现了单细胞类型注释,识别出多种细胞亚型,并在复杂病理环境中保持稳定性能,为临床诊断、药物发现和大规模研究提供了低成本、高分辨率的解决方案。
Research|从病理图像预测单细胞空间转录组:PRTS 开启低成本高分辨率空间生物学新时代
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