文章摘要
本研究通过整合5个已发表的鸭基因组,构建了首个鸭线性泛基因组,捕获了约40.98 Mb参考基因组中不存在的新序列。研究目的旨在利用泛基因组全面鉴定结构变异(SVs),并探究转座子(TE)来源的SVs在鸭驯化和改良过程中对重要经济性状的影响。研究结论揭示,位于IGF2BP1基因启动子区的6,945 bp Gypsy转座子插入通过上调该基因表达显著增加鸭体重,解释了表型变异的27.61%;同时,MITF基因内含子区的6,634 bp Gypsy插入诱导产生新的嵌合转录本,导致白羽性状形成。这些发现强调了泛基因组在基因组学研究中的重要性,并证实转座子插入是影响鸭体重和羽色性状的原因突变。
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