Nat Commun丨景乃禾、索生宝课题组合作构建小鼠胚胎原肠运动过程的时空多组学调控网络图谱

背景：胚胎发育，尤其是哺乳动物原肠运动阶段，对理解生命本质和疾病机制至关重要。该过程涉及复杂的细胞命运决定和时空模式建成，传统单组学方法难以全面解析其调控机制。研究目的：为系统揭示小鼠胚胎原肠运动过程中的分子调控逻辑，景乃禾与索生宝团队合作，旨在构建整合基因表达、染色质可及性、转录因子活性、信号通路响应性及细胞时空定位的时空多组学调控网络图谱。结论：研究开发了BioCRE算法，构建了ST-MAGIC和ST-MAGIC(+)框架，首次实现了五维数据的有机整合。系统阐明了胚层谱系命运决定中关键转录因子（如Eomes、Foxa2、Noto、Pou6f1）和信号通路（如NODAL、WNT）的时序接力规律，发现了左-右体轴在表观遗传层面的“早期不对称”编程，并验证了Noto和Pou6f1在结点细胞成熟及纤毛发生中的关键作用。该工作为理解胚胎发育的底层调控逻辑提供了通用框架和重要基础。