Plant Com | 中科院遗传与发育所梁承志研究团队番茄T2T基因组助力解析基因组演化奥秘

本研究针对现有番茄参考基因组SL5.0存在的31处缺口和缺失问题，利用ONT超长测序技术构建了高质量番茄端粒到端粒参考基因组SL-T2T。研究目的旨在获得完整度更高的基因组序列以支持功能基因组学研究。研究结果显示：SL-T2T基因组全长831.45 Mb，填补了所有非45S区域缺口，修正了结构错误；系统分析了45S rDNA特征，发现其具有2105个高度同源的完整重复单位，揭示其在数百万年内经历急剧扩增的特殊演化模式；全基因组甲基化分析显示LTR和串联重复区域甲基化水平显著偏高，45S区域呈现全基因组最高mCG/mCHG位点密度，证实甲基化在维持基因组稳定性中的重要作用。