Sci China Life Sci丨曾木圣/钟茜团队开发Clier-seq技术,绘制全转录组糖基化RNA图谱
BioArtMED
2025-11-07 14:30
文章摘要
近年来研究发现RNA分子可发生糖基化修饰形成glycoRNA,成为新型信号分子参与细胞通讯。为系统解析全转录组范围内的糖基化RNA分布,研究团队开发了Clier-seq技术平台,通过蔗糖密度梯度离心结合代谢标记与点击化学方法,首次发现长度达2000 nt的RNA也存在糖基化修饰。该技术建立了标准化流程包括高效富集、链特异性建库和全转录组定量分析,显著提升检测覆盖度。在鼻咽上皮细胞和B淋巴细胞中的应用表明,tRNA是主要糖基化类型,其中tRNA-Ser、tRNA-Thr等修饰显著,同时鉴定出Vault RNA及新型lncRNA的糖基化修饰。通过ARPLA技术和生物信息学工具实现了单细胞水平可视化与位点预测。该研究为glycoRNA功能研究和生物标志物开发提供了重要方法学基础。
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