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Nat Biotech | 中国科学院动物研究所赵方庆团队提出面向TB级数据的环形RNA高效挖掘算法

AutophagyAdvances 2025-10-05 18:11
文章摘要
本文背景是环形RNA因其稳定性和在基因调控及疾病研究中的重要性而成为研究热点，但现有检测工具存在效率低、灵敏度不足的问题。研究目的是开发一种名为CIRI3的高效算法，以实现在TB级转录组数据中快速、精准地检测和定量环形RNA，并构建相关数据库支持癌症研究。结论显示CIRI3显著提升了环形RNA的检出率和灵敏度，构建了CIRIonco数据库，并通过AI模型实现了疾病表型预测，为癌症分型和诊断提供了方法学工具和数据基础。
Nat Biotech | 中国科学院动物研究所赵方庆团队提出面向TB级数据的环形RNA高效挖掘算法
查看文献： Detecting and quantifying circular RNAs in terabyte-scale RNA-seq datasets with CIRI3.
查看期刊： Nature biotechnology
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