Chem Sci｜分层一致性扩散模型助力靶蛋白结合分子生成

背景：靶向蛋白结合的分子生成是药物发现中的关键环节，但现有基于原子或基序的三维生成模型在有效性和可靠性方面存在不足。研究目的：研究人员提出原子-基序一致性扩散模型（AMDiff），通过多视角联合训练和分层扩散架构，结合原子与基序视角，以生成更适配靶蛋白结合口袋的分子。结论：AMDiff在多样本测试中表现出优异有效性（98.9%）、新颖性和结合亲和力，尤其在ALK和CDK4激酶案例中验证了其应用潜力，能够适应蛋白突变和不同口袋尺度，为结构驱动分子设计提供新解决方案。