文献解读｜中国农科院深圳基因组所潘玮华团队开发新算法TRFill，解决重复序列组装难题

该研究由中国农业科学院深圳农业基因组研究所潘玮华团队联合国内外多个研究团队共同完成，发表在《基因组生物学》上。研究背景是大多数物种的基因组组装由于重复区域的复杂性而不完整，影响后续分析准确性。研究目的是开发一种新算法TRFill，利用HiFi和Hi-C数据结合近缘物种参考基因组，填补复杂重复区域的缺口，提高基因组完整性。研究结果表明，TRFill在人类二倍体HG002着丝粒序列和番茄群体基因组端粒附近串联重复区域的组装中，能显著提升重复序列的完整性和准确性，为群体水平重复序列研究提供了新工具。