福建农林大学博士生以第一作者身份在国际权威期刊(IF=19.4)上发表研究论文
植物研究进展
2025-08-09 19:34
文章摘要
本文介绍了福建农林大学资源与环境学院环境基因组团队在《Nature Protocols》期刊上发表的一篇方法类文章,题为“A workflow for statistical analysis and visualization of microbiome omics data using the R microeco package”。文章背景是微生物组领域实验设计日益复杂、数据量激增,以及组学数据类型的多样化,使得统计分析与可视化面临巨大挑战。研究目的是提出一套基于R语言microeco包的分步式分析方案,系统阐述微生物组数据的统计分析和可视化流程。该方案涵盖扩增子测序数据、宏基因组测序数据及非靶向代谢组数据的分析,包括数据预处理、核心物种识别、多样性分析、差异丰度检验及机器学习等关键步骤。结论是该方案全面且具备良好的可扩展性,能应对复杂分析需求。
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