ICML｜通过可组合几何约束进行零样本的环肽设计

本文介绍了ICML2025上发表的论文"Zero-Shot Cyclic Peptide Design via Composable Geometric Constraints"，该研究针对环肽设计数据稀缺的问题，提出了一种新型生成框架CP-Composer。背景方面，环肽相对于线性肽具有额外的生化特性，但由于训练数据有限，设计特定类型的环肽较为困难。研究目的是通过将复杂的环化模式分解为残基约束，并利用几何条件编码这些约束，实现零样本的环肽设计。结论显示，CP-Composer在不同环化策略上达到了38%到84%的成功率，有效增强了构象稳定性，为环状肽设计提供了一种原则性方法，并具有扩展到更广泛生物分子应用的潜力。