Nature | 中国农科院发表水稻多器官单细胞图谱，解析细胞类型对重要性状调控作用

本研究由中国农业科学院生物技术研究所联合多家科研机构完成，发表在《Nature》上，构建了首个水稻多器官单细胞多组学图谱。研究通过10x Genomics单细胞多组学平台，获取了水稻8个主要器官超11万个细胞的RNA表达与染色质可及性数据，鉴定出54个细胞类型。团队开发了水稻细胞命运扰动模拟算法和基于染色质可及性区域DNA序列motif富集度与转录因子表达趋势相结合的预测流程，精准预测单细胞水平功能方向。此外，研究还整合了水稻群体GWAS结果至单细胞分辨率网络，建立了“基因-细胞类型-性状”三维精准关联图，挖掘并功能验证了三个关键调控基因。研究还首次发现“过渡态细胞”，揭示了细胞分化调控的复杂性和层次感。最后，团队开发了Rice-SCMR平台，为全球科研社区提供共享与合作平台。这些成果为水稻设计育种提供了细胞水平上的特异性候选靶点。