华中农业大学本科生共同一作在植物科学顶级期刊(IF=17.1)发表研究成果!
溪远讲植物科学
2025-02-08 12:01
文章摘要
本研究由华中农业大学玉米团队在Molecular Plant期刊上发表,题为“GEFormer: a Genomic Prediction Method of Genotype-Environment Interaction in Maize by Integrating Gating Mechanism MLP and Linear Attention Mechanism”。研究背景基于玉米、水稻等作物的田间表型由基因型与环境共同作用的事实,旨在通过开发新的基因组预测方法提高作物田间表型预测的准确率。研究内容介绍了GEFormer方法,该方法融合门控机制MLP与线性注意力机制,通过三个功能模块提取基因型和环境特征,进而捕获复杂的非线性关系。研究结果表明,GEFormer在多个物种的多套群体中预测准确率优于现有方法,且在不同环境和材料中表现出良好的泛化能力。结论指出,GEFormer在预测未知环境表型、基于自交系预测杂交种表型及跨群体表型预测中具有应用潜力,未来有望通过集成更多群体数据集突破遗传背景群体间的瓶颈。
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