清华大学智能产业研究院AIR-解码基因调控-GET模型 | Nature

本文介绍了清华大学智能产业研究院兰艳艳教授与哥伦比亚大学、卡内基梅隆大学合作的研究成果，发表在Nature上。研究开发了一种名为GET的可解释基础模型，该模型利用染色质可及性数据和序列信息，通过自监督预训练和微调，实现了在多种细胞类型中准确预测基因表达的能力。GET模型不仅在预测基因表达水平、识别顺式调控元件及推断转录因子物理互作方面表现出色，还在B细胞急性淋巴细胞白血病研究中揭示了PAX5和NR2C2转录因子之间的特异性互作关系，为理解细胞命运决定和疾病发生提供了新的视角。