Baker 预印本 | 用ChemNet建模蛋白-小分子构象合集

本文介绍了一种名为ChemNet的模型，用于在原子水平上建模小分子和蛋白之间的相互作用，特别关注构象异质性。研究目的在于提高小分子构象生成的准确性和适用性，通过扩散模型进行结构去噪，从而在给定蛋白活性位点的情况下生成精确的小分子结构和侧链位置。结论表明，ChemNet不仅提高了小分子构象生成的精度，还能在非原生口袋上表现良好，适用于酶和小分子binder的设计，提供了一个通用且快速的构象集生成器。