Bioinformatics｜沙特阿卜杜拉国王科技大学高欣团队：基于生成式预训练Transformer的大环肽从头设计

大环肽因其独特的化学结构和生物活性，在药物开发中具有重要潜力。然而，传统的设计方法耗时且成本高昂。沙特阿卜杜拉国王科技大学高欣团队开发了一种基于生成式预训练Transformer（GPT）和分子层次编辑语言（HELM）的新方法——HELM-GPT，用于大环肽的从头设计。该方法通过强化学习优化肽链属性，实现了高效、新颖的大环肽设计，具有高细胞膜通透性和药物靶向性。研究展示了HELM-GPT在细胞通透性和KRAS结合亲和力优化方面的显著效果，为未来的生物制药领域提供了新的工具和方法。