Nature Genetics|基因组结构变异重塑油菜基因表达和性状变异机制

本研究由中国农科院油料所和华中农大联合进行，揭示了基因组结构变异（SV）在油菜基因表达和性状变异中的调控机制。研究基于16个甘蓝型油菜基因组和2,105份重测序的核心种质资源，构建了油菜物种水平的Pan-SV基因组，并结合群体5个组织的转录组数据，鉴定了基因表达调控的SV-eQTL。研究者总结出八种关键的SV调控基因表达的分子机制，并开发了高通量的GWAS+eQTL+TWAS+COLOC联合分析方法，鉴定了油菜54种重要农艺性状的726个“SV→Gene Expression→Trait Variation”因果关系及其调控网络。此外，研究还解析了硫代葡萄糖苷合成和转运代谢途径，揭示了硫苷合成和转运相偶联的机制，并通过基因编辑技术创制出抗病虫油菜新种质。该研究为油菜基因组研究和生物育种产业提供了全面的基因资源和优异育种材料。