连发两篇!山东大学博士生在一区top期刊(IF5y=16.5)发表研究成果,取得纳米孔多样本测序问题上的系列进展

Ad植物微生物 2024-11-14 14:23
文章摘要
山东大学数学与交叉科学研究中心团队在纳米孔多样本测序问题上取得重要进展,连续在Genome Biology和Fundamental Research期刊上发表研究成果。博士研究生祁俊海在Genome Biology上发表了两篇论文,分别提出了HycDemux和TDFPS-Designer两种算法。HycDemux是一种结合GPU并行的混合聚类算法,用于精确的纳米孔测序数据解复用,实验表明其在短序列聚类方面优于现有工具。TDFPS-Designer则是一种用于纳米孔测序条形码设计的新工具包,能够创建更多条形码,解复用召回率比Guppy提高了20%。此外,博士研究生任梓彤在Fundamental Research上发表的研究论文提出了PRO算法,通过概率差异性度量设计出高效的条形码套件,解复用精度达到98.29%,优于纳米孔官方工具Guppy。这些研究展示了山东大学在纳米孔测序技术上的创新能力和领先地位。
连发两篇!山东大学博士生在一区top期刊(IF5y=16.5)发表研究成果,取得纳米孔多样本测序问题上的系列进展
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