Nature Genetics||基因组所周永锋团队建立首个葡萄全基因组选择育种体系

中国农业科学院深圳农业基因组研究所周永锋团队在《自然·遗传学》上发表了题为“Grapevine pangenome facilitates trait genetics and genomic breeding”的研究论文，构建了首个驯化葡萄图形泛参考基因组（Grapepan v1.0）。该研究通过整合三代基因组测序技术和机器学习算法，成功消除了单参考基因组的偏差，构建了包含单核苷酸变异（SNP）、插入缺失变异（InDel）和结构变异（SV）的葡萄基因型图谱与重要育种性状的表型图谱。研究解析了葡萄复杂农艺性状的遗传基础，定位了29个农艺性状相关的数量性状基因位点(QTLs)，并发现结构变异对农艺性状的遗传力有显著贡献。通过整合机器学习算法和基因组选择模型，该研究构建了葡萄全基因组选择育种体系，将有效缩短育种年限、降低育种成本、提高育种效率，为我国快速突破葡萄种业瓶颈奠定了基础。