至少Nature Gnetics起步，甚至Nature正刊茄属泛基因组揭示重复基因在作物育种中的作用和命运

本文通过构建茄属（Solanum）泛基因组，结合功能基因组学与遗传学，展示了基因重复及其旁系同源基因分化对基因型与表型可预测性的影响。研究结果表明，尽管染色体水平参考基因组之间的基因宏共线性保持了广泛的保守性，但全局性和谱系特异性基因重复在旁系同源基因序列、表达和功能方面展现了动态的进化轨迹。通过扩展泛基因组，纳入非洲茄子的栽培品种，揭示了旁系同源基因的起源与进化的复杂历史，特别是在关键驯化基因家族的成员之间。研究强调了旁系同源基因在短期进化过程中的多样化对可进化性和独立作物驯化历史的重要性，并指出这些发现对于在近缘物种间实现从基因型到表型的转化至关重要。