与家族性阿尔茨海默病相关的前驱素-1、前驱素-2和淀粉样前体蛋白突变的生物信息学特征

Q4 Medicine
Alejandro Soto-Ospina, Elías Cataño-Sánchez, Gabriel Bedoya-Berrío, Pedronel Araque-Marín, Andrés Villegas-Lanau
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Metodología: Se recopila la información reportada de las bases de datos Alzforum, Pubmed, Uniprot y Embl, el análisis de susceptibilidad a la mutación se hace con el software SNAP2 de Rostlab y las modificaciones postraduccionales se hacen con la herramienta Swiss-ExPASY. Resultados: Se establece una tabla de frecuencias orientada a los casos clínicos asociados a las mutaciones missenses que producen enfermedad de Alzheimer y se encontró la frecuencia de cambios de aminoácido y se comparó con la composición de aminoácidos presentes para PS1, con un porcentaje de 12% para Leu, en PS2 con Leu en 12.9% y para el fragmento carboxi terminal de APP de 99 aminoácidos con un valor de 13.1% para Val. Discusión y conclusión: Los aminoacidos que producen el cambio a partir de sus características químicas, fueron más frecuentes los no polares y se estima que se da por la proporción tan alta de estructura proteica localizada en la membrana neuronal. 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摘要

简介:阿尔茨海默病表现为神经组织损伤导致的神经元死亡,其神经病理标志是淀粉样斑块和神经纤维球等蛋白质的沉积。目的:将家族性阿尔茨海默病的临床报告与易感区域10个选定突变的变化联系起来,从生物信息学特征了解其对蛋白质结构的影响。方法:收集Alzforum、Pubmed、Uniprot和Embl数据库的报告信息,使用Rostlab的SNAP2软件进行突变敏感性分析,使用Swiss-ExPASY工具进行翻译后修改。结果:建立面向临床病例表频率突变相关missenses发现阿尔茨海默病并改变氨基酸和频率与在场的氨基酸组成比较PS1,占12%为傣族、12.9%和碎片在PS2与傣族carboxi APP终端在99年的氨基酸有13.1%值瓦尔。讨论和结论:根据其化学特性产生变化的氨基酸,非极性氨基酸更为常见,据估计,这是由于位于神经元膜上的蛋白质结构比例如此之高。通过敏感性分析,在极性变化的指导下,补充了蛋白质结构中20个氨基酸变化的影响。
本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
Caracterización bioinformática de mutaciones en las proteínas presenilina-1, presenilina-2 y proteína precursora de amiloide en relación con enfermedad de Alzheimer familiar
Introducción: La enfermedad de Alzheimer se manifiesta como la muerte neuronal debido al daño en el tejido nervioso y cuyo marcador neuropatológico, son los depósitos de proteína como placas amiloide y ovillos neurofibrilares. Objetivo: Relacionar la clínica reportada para la enfermedad de Alzheimer Familiar y los cambios de 10 mutaciones seleccionadas en las regiones susceptibles, para entender el efecto en la estructura proteica, a partir de la caracterización bioinformática. Metodología: Se recopila la información reportada de las bases de datos Alzforum, Pubmed, Uniprot y Embl, el análisis de susceptibilidad a la mutación se hace con el software SNAP2 de Rostlab y las modificaciones postraduccionales se hacen con la herramienta Swiss-ExPASY. Resultados: Se establece una tabla de frecuencias orientada a los casos clínicos asociados a las mutaciones missenses que producen enfermedad de Alzheimer y se encontró la frecuencia de cambios de aminoácido y se comparó con la composición de aminoácidos presentes para PS1, con un porcentaje de 12% para Leu, en PS2 con Leu en 12.9% y para el fragmento carboxi terminal de APP de 99 aminoácidos con un valor de 13.1% para Val. Discusión y conclusión: Los aminoacidos que producen el cambio a partir de sus características químicas, fueron más frecuentes los no polares y se estima que se da por la proporción tan alta de estructura proteica localizada en la membrana neuronal. Con el análisis de susceptibilidad se complementa el efecto del cambio para los 20 aminoacidos en la estructura de la proteína, orientada por los cambios de polaridad.
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Archivos de Neurociencias
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期刊介绍: La revista Archivos de Neurociencias es una publicación trimestral que bajo el patrocinio del Instituto Nacional de Neurología y Neurocirugía Manuel Velasco Suárez, se dedica a publicar artículos relacionados con las neurociencias, tanto nacionales como extranjeros procurando tener una estricta relación con los interesados en áreas afines de habla hispana. De 1966 a 1980 apareció como Revista del Instituto Nacional de Neurología. De 1986 a 1995 apareció como Archivos del Instituto Nacional de Neurología y Neurocirugía.
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