捷克1700种维管植物群的基因组大小和基因组鸟嘌呤+胞嘧啶(GC)含量的新估计

IF 4.4 2区 生物学 Q1 PLANT SCIENCES
Preslia Pub Date : 2019-06-01 DOI:10.23855/PRESLIA.2019.117
P. Šmarda, Ondřej Knápek, Alexandra Březinová, L. Horová, V. Grulich, J. Danihelka, P. Veselý, J. Šmerda, O. Rotreklová, P. Bureš
{"title":"捷克1700种维管植物群的基因组大小和基因组鸟嘌呤+胞嘧啶(GC)含量的新估计","authors":"P. Šmarda, Ondřej Knápek, Alexandra Březinová, L. Horová, V. Grulich, J. Danihelka, P. Veselý, J. Šmerda, O. Rotreklová, P. Bureš","doi":"10.23855/PRESLIA.2019.117","DOIUrl":null,"url":null,"abstract":"Obsah DNA v somatických, nereplikovaných jadrech buněk (velikost genomu) a bazove složeni DNA (GC obsah) jsou zakladni genomicke parametry, ktere lze měřit pomoci průtokove cytometrie. Velikost genomu, a tedy i ploidni uroveň mohou ovlivňovat cetne vlastnosti rostlin, a proto se uvaději v modernich biologických florach a databazich biologických vlastnosti druhů. Velikost genomu se dosud měři převažně pro biosystematicke ucely a navzdory velkemu rozvoji průtokove cytometrie v Ceske republice tato informace pro mnohe druhy ceske květeny chybi. Biologický význam GC obsahu je oproti významu velikosti genomu zatim meně jasný, navic se měři obtižněji, a proto jej nezname u velke větsiny druhů. V teto praci přinasime měřeni obou genomických parametrů pro větsinu cevnatých rostlin ceske květeny. Celkem jsme naměřili nově velikosti genomu a genomický GC obsah pro 1908 vzorků 1700 druhů. Velikost genomu je zde poprve uvedena pro vice než 1000 druhů a obsah GC bazi poprve pro vice než 1500 druhů, což vice než zdvojnasobuje množstvi dosud znamých udajů o obsahu GC bazi u cevnatých rostlin. Spolu s dřive uveřejněnými udaji ziskanými v nasi laboratoři na stejných přistrojich a stejnou metodikou jsou tak tyto udaje dostupne pro 1910 druhů ceske květeny (~83 % soucasne flory bez apomiktů, přechodně zavlecných a vyhynulých druhů). Tyto udaje jsou uspořadany do tabulky a doplněny udaji o poctu chromozomů, ploidni urovni a vypoctene monoploidni velikosti genomu. V clanku přinasime popisnou analýzu tohoto datoveho souboru a diskutujeme o některých cytogeograficky pozoruhodných poznatcich. Tento přehled představuje největsi a nejuplnějsi soubor genomických dat pro květenu jednoho statu. Zde prezentovane výsledky tvoři zaklad karyologicke casti ceske databaze druhových vlastnosti Pladias (www.pladias.cz) a budou využity pro analýzy evoluce a biologickeho významu obou měřených genomických parametrů.","PeriodicalId":20501,"journal":{"name":"Preslia","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":4.4000,"publicationDate":"2019-06-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":"39","resultStr":"{\"title\":\"Genome sizes and genomic guanine+cytosine (GC) contents of the Czech vascular flora with new estimates for 1700 species\",\"authors\":\"P. Šmarda, Ondřej Knápek, Alexandra Březinová, L. Horová, V. Grulich, J. Danihelka, P. Veselý, J. Šmerda, O. Rotreklová, P. Bureš\",\"doi\":\"10.23855/PRESLIA.2019.117\",\"DOIUrl\":null,\"url\":null,\"abstract\":\"Obsah DNA v somatických, nereplikovaných jadrech buněk (velikost genomu) a bazove složeni DNA (GC obsah) jsou zakladni genomicke parametry, ktere lze měřit pomoci průtokove cytometrie. Velikost genomu, a tedy i ploidni uroveň mohou ovlivňovat cetne vlastnosti rostlin, a proto se uvaději v modernich biologických florach a databazich biologických vlastnosti druhů. Velikost genomu se dosud měři převažně pro biosystematicke ucely a navzdory velkemu rozvoji průtokove cytometrie v Ceske republice tato informace pro mnohe druhy ceske květeny chybi. Biologický význam GC obsahu je oproti významu velikosti genomu zatim meně jasný, navic se měři obtižněji, a proto jej nezname u velke větsiny druhů. V teto praci přinasime měřeni obou genomických parametrů pro větsinu cevnatých rostlin ceske květeny. Celkem jsme naměřili nově velikosti genomu a genomický GC obsah pro 1908 vzorků 1700 druhů. Velikost genomu je zde poprve uvedena pro vice než 1000 druhů a obsah GC bazi poprve pro vice než 1500 druhů, což vice než zdvojnasobuje množstvi dosud znamých udajů o obsahu GC bazi u cevnatých rostlin. Spolu s dřive uveřejněnými udaji ziskanými v nasi laboratoři na stejných přistrojich a stejnou metodikou jsou tak tyto udaje dostupne pro 1910 druhů ceske květeny (~83 % soucasne flory bez apomiktů, přechodně zavlecných a vyhynulých druhů). Tyto udaje jsou uspořadany do tabulky a doplněny udaji o poctu chromozomů, ploidni urovni a vypoctene monoploidni velikosti genomu. V clanku přinasime popisnou analýzu tohoto datoveho souboru a diskutujeme o některých cytogeograficky pozoruhodných poznatcich. Tento přehled představuje největsi a nejuplnějsi soubor genomických dat pro květenu jednoho statu. Zde prezentovane výsledky tvoři zaklad karyologicke casti ceske databaze druhových vlastnosti Pladias (www.pladias.cz) a budou využity pro analýzy evoluce a biologickeho významu obou měřených genomických parametrů.\",\"PeriodicalId\":20501,\"journal\":{\"name\":\"Preslia\",\"volume\":null,\"pages\":null},\"PeriodicalIF\":4.4000,\"publicationDate\":\"2019-06-01\",\"publicationTypes\":\"Journal Article\",\"fieldsOfStudy\":null,\"isOpenAccess\":false,\"openAccessPdf\":\"\",\"citationCount\":\"39\",\"resultStr\":null,\"platform\":\"Semanticscholar\",\"paperid\":null,\"PeriodicalName\":\"Preslia\",\"FirstCategoryId\":\"99\",\"ListUrlMain\":\"https://doi.org/10.23855/PRESLIA.2019.117\",\"RegionNum\":2,\"RegionCategory\":\"生物学\",\"ArticlePicture\":[],\"TitleCN\":null,\"AbstractTextCN\":null,\"PMCID\":null,\"EPubDate\":\"\",\"PubModel\":\"\",\"JCR\":\"Q1\",\"JCRName\":\"PLANT SCIENCES\",\"Score\":null,\"Total\":0}","platform":"Semanticscholar","paperid":null,"PeriodicalName":"Preslia","FirstCategoryId":"99","ListUrlMain":"https://doi.org/10.23855/PRESLIA.2019.117","RegionNum":2,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":null,"EPubDate":"","PubModel":"","JCR":"Q1","JCRName":"PLANT SCIENCES","Score":null,"Total":0}
引用次数: 39

摘要

本文章由计算机程序翻译,如有差异,请以英文原文为准。
Genome sizes and genomic guanine+cytosine (GC) contents of the Czech vascular flora with new estimates for 1700 species
Obsah DNA v somatických, nereplikovaných jadrech buněk (velikost genomu) a bazove složeni DNA (GC obsah) jsou zakladni genomicke parametry, ktere lze měřit pomoci průtokove cytometrie. Velikost genomu, a tedy i ploidni uroveň mohou ovlivňovat cetne vlastnosti rostlin, a proto se uvaději v modernich biologických florach a databazich biologických vlastnosti druhů. Velikost genomu se dosud měři převažně pro biosystematicke ucely a navzdory velkemu rozvoji průtokove cytometrie v Ceske republice tato informace pro mnohe druhy ceske květeny chybi. Biologický význam GC obsahu je oproti významu velikosti genomu zatim meně jasný, navic se měři obtižněji, a proto jej nezname u velke větsiny druhů. V teto praci přinasime měřeni obou genomických parametrů pro větsinu cevnatých rostlin ceske květeny. Celkem jsme naměřili nově velikosti genomu a genomický GC obsah pro 1908 vzorků 1700 druhů. Velikost genomu je zde poprve uvedena pro vice než 1000 druhů a obsah GC bazi poprve pro vice než 1500 druhů, což vice než zdvojnasobuje množstvi dosud znamých udajů o obsahu GC bazi u cevnatých rostlin. Spolu s dřive uveřejněnými udaji ziskanými v nasi laboratoři na stejných přistrojich a stejnou metodikou jsou tak tyto udaje dostupne pro 1910 druhů ceske květeny (~83 % soucasne flory bez apomiktů, přechodně zavlecných a vyhynulých druhů). Tyto udaje jsou uspořadany do tabulky a doplněny udaji o poctu chromozomů, ploidni urovni a vypoctene monoploidni velikosti genomu. V clanku přinasime popisnou analýzu tohoto datoveho souboru a diskutujeme o některých cytogeograficky pozoruhodných poznatcich. Tento přehled představuje největsi a nejuplnějsi soubor genomických dat pro květenu jednoho statu. Zde prezentovane výsledky tvoři zaklad karyologicke casti ceske databaze druhových vlastnosti Pladias (www.pladias.cz) a budou využity pro analýzy evoluce a biologickeho významu obou měřených genomických parametrů.
求助全文
通过发布文献求助,成功后即可免费获取论文全文。 去求助
来源期刊
Preslia
Preslia 生物-植物科学
CiteScore
5.20
自引率
29.40%
发文量
8
审稿时长
>12 weeks
期刊介绍: Preslia is a peer-reviewed scientific journal publishing original research papers on plant systematics, morphology, phytogeography, ecology and vegetation science, with a geographical focus on central Europe. The journal was founded in 1914 and named in honour of brothers Jan Svatopluk Presl (1791–1849) and Karel Bořivoj Presl (1794–1852), outstanding Bohemian botanists. It is published quarterly by the Czech Botanical Society.
×
引用
GB/T 7714-2015
复制
MLA
复制
APA
复制
导出至
BibTeX EndNote RefMan NoteFirst NoteExpress
×
提示
您的信息不完整,为了账户安全,请先补充。
现在去补充
×
提示
您因"违规操作"
具体请查看互助需知
我知道了
×
提示
确定
请完成安全验证×
copy
已复制链接
快去分享给好友吧!
我知道了
右上角分享
点击右上角分享
0
联系我们:info@booksci.cn Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。 Copyright © 2023 布克学术 All rights reserved.
京ICP备2023020795号-1
ghs 京公网安备 11010802042870号
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:481959085
Book学术官方微信